Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRSF11Q05519 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRSF11Q05519 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRSF11Q05519 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRSF11Q05519 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRSF11Q05519 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SRSF11Q05519 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRSF11Q05519 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRSF11Q05519 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRSF11Q05519 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRSF11Q05519 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRSF11Q05519 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRSF11Q05519 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRSF11Q05519 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRSF11Q05519 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRSF11Q05519 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRSF11Q05519 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRSF11Q05519 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRSF11Q05519 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SRSF11Q05519 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRSF11Q05519 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRSF11Q05519 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRSF11Q05519 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SRSF11Q05519 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRSF11Q05519 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRSF11Q05519 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRSF11Q05519 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRSF11Q05519 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRSF11Q05519 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SRSF11Q05519 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRSF11Q05519 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRSF11Q05519 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRSF11Q05519 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRSF11Q05519 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRSF11Q05519 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRSF11Q05519 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRSF11Q05519 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRSF11Q05519 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRSF11Q05519 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRSF11Q05519 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRSF11Q05519 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRSF11Q05519 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRSF11Q05519 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRSF11Q05519 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRSF11Q05519 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRSF11Q05519 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRSF11Q05519 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRSF11Q05519 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRSF11Q05519 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRSF11Q05519 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms