Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRKCZQ05513 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRKCZQ05513 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKCZQ05513 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKCZQ05513 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKCZQ05513 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKCZQ05513 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKCZQ05513 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKCZQ05513 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKCZQ05513 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKCZQ05513 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKCZQ05513 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKCZQ05513 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKCZQ05513 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKCZQ05513 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKCZQ05513 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKCZQ05513 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKCZQ05513 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKCZQ05513 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKCZQ05513 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKCZQ05513 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKCZQ05513 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKCZQ05513 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKCZQ05513 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKCZQ05513 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKCZQ05513 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKCZQ05513 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKCZQ05513 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKCZQ05513 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKCZQ05513 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKCZQ05513 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKCZQ05513 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRKCZQ05513 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRKCZQ05513 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKCZQ05513 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKCZQ05513 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKCZQ05513 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKCZQ05513 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKCZQ05513 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKCZQ05513 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKCZQ05513 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKCZQ05513 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKCZQ05513 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKCZQ05513 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKCZQ05513 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKCZQ05513 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCZQ05513 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCZQ05513 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCZQ05513 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCZQ05513 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCZQ05513 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCZQ05513 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCZQ05513 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKCZQ05513 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRKCZQ05513 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKCZQ05513 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKCZQ05513 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKCZQ05513 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKCZQ05513 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKCZQ05513 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKCZQ05513 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKCZQ05513 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKCZQ05513 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKCZQ05513 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKCZQ05513 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKCZQ05513 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKCZQ05513 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKCZQ05513 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKCZQ05513 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKCZQ05513 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKCZQ05513 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKCZQ05513 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKCZQ05513 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKCZQ05513 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKCZQ05513 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKCZQ05513 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRKCZQ05513 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRKCZQ05513 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PRKCZQ05513 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRKCZQ05513 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PRKCZQ05513 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKCZQ05513 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKCZQ05513 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKCZQ05513 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKCZQ05513 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKCZQ05513 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKCZQ05513 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKCZQ05513 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKCZQ05513 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKCZQ05513 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKCZQ05513 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKCZQ05513 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKCZQ05513 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKCZQ05513 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKCZQ05513 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKCZQ05513 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms