Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD164Q04900 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD164Q04900 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD164Q04900 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD164Q04900 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD164Q04900 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD164Q04900 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD164Q04900 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD164Q04900 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD164Q04900 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD164Q04900 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD164Q04900 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD164Q04900 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD164Q04900 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD164Q04900 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD164Q04900 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CD164Q04900 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CD164Q04900 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CD164Q04900 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CD164Q04900 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CD164Q04900 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CD164Q04900 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CD164Q04900 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CD164Q04900 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CD164Q04900 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD164Q04900 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD164Q04900 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD164Q04900 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD164Q04900 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD164Q04900 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CD164Q04900 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD164Q04900 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD164Q04900 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD164Q04900 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD164Q04900 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD164Q04900 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD164Q04900 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CD164Q04900 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD164Q04900 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CD164Q04900 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD164Q04900 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD164Q04900 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD164Q04900 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD164Q04900 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD164Q04900 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD164Q04900 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD164Q04900 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD164Q04900 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD164Q04900 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD164Q04900 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD164Q04900 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD164Q04900 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD164Q04900 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD164Q04900 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD164Q04900 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD164Q04900 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD164Q04900 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD164Q04900 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD164Q04900 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD164Q04900 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD164Q04900 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD164Q04900 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD164Q04900 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CD164Q04900 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD164Q04900 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD164Q04900 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD164Q04900 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD164Q04900 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD164Q04900 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD164Q04900 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD164Q04900 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD164Q04900 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CD164Q04900 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CD164Q04900 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CD164Q04900 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CD164Q04900 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CD164Q04900 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CD164Q04900 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CD164Q04900 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CD164Q04900 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CD164Q04900 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CD164Q04900 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CD164Q04900 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CD164Q04900 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CD164Q04900 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CD164Q04900 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CD164Q04900 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CD164Q04900 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CD164Q04900 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CD164Q04900 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CD164Q04900 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CD164Q04900 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CD164Q04900 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CD164Q04900 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CD164Q04900 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CD164Q04900 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CD164Q04900 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CD164Q04900 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CD164Q04900 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CD164Q04900 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms