Protein–RNA interactions for Protein: Q04712

RRN11, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN11, yeastyeast

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11Q04712 NTG2YOL043C 1143 nt6.52□□□□□ -1.37
RRN11Q04712 FMP40YPL222W 2067 nt6.52□□□□□ -1.37
RRN11Q04712 KIN1YDR122W 3195 nt6.52□□□□□ -1.37
RRN11Q04712 EXG2YDR261C 1689 nt6.52□□□□□ -1.37
RRN11Q04712 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt6.51□□□□□ -1.37
RRN11Q04712 TAF9YMR236W 474 nt6.51□□□□□ -1.37
RRN11Q04712 LCL3YGL085W 825 nt6.5□□□□□ -1.37
RRN11Q04712 SEC23YPR181C 2307 nt6.5□□□□□ -1.37
RRN11Q04712 ACS1YAL054C 2142 nt6.5□□□□□ -1.37
RRN11Q04712 GLN3YER040W 2193 nt6.5□□□□□ -1.37
RRN11Q04712 AVT4YNL101W 2142 nt6.49□□□□□ -1.37
RRN11Q04712 LDB19YOR322C 2457 nt6.49□□□□□ -1.37
RRN11Q04712 DMC1YER179W 1005 nt6.49□□□□□ -1.37
RRN11Q04712 ASF1YJL115W 840 nt6.49□□□□□ -1.37
RRN11Q04712 SCS22YBL091C-A 528 nt6.49□□□□□ -1.37
RRN11Q04712 RDR1YOR380W 1641 nt6.49□□□□□ -1.37
RRN11Q04712 ATF1YOR377W 1578 nt6.48□□□□□ -1.37
RRN11Q04712 MHP1YJL042W 4197 nt6.48□□□□□ -1.37
RRN11Q04712 PCS60YBR222C 1632 nt6.48□□□□□ -1.37
RRN11Q04712 EHD3YDR036C 1503 nt6.48□□□□□ -1.37
RRN11Q04712 CEF1YMR213W 1773 nt6.48□□□□□ -1.37
RRN11Q04712 HHY1YEL059W 309 nt6.47□□□□□ -1.37
RRN11Q04712 YGL102CYGL102C 429 nt6.47□□□□□ -1.37
RRN11Q04712 PTC7YHR076W 1032 nt6.47□□□□□ -1.37
RRN11Q04712 ERG27YLR100W 1044 nt6.47□□□□□ -1.37
RRN11Q04712 ATP4YPL078C 735 nt6.47□□□□□ -1.37
RRN11Q04712 NUP84YDL116W 2181 nt6.47□□□□□ -1.37
RRN11Q04712 VHT1YGR065C 1782 nt6.46□□□□□ -1.37
RRN11Q04712 DUG1YFR044C 1446 nt6.46□□□□□ -1.38
RRN11Q04712 THR1YHR025W 1074 nt6.46□□□□□ -1.38
RRN11Q04712 RPL2BYIL018W 765 nt6.46□□□□□ -1.38
RRN11Q04712 YKL153WYKL153W 510 nt6.46□□□□□ -1.38
RRN11Q04712 ILV6YCL009C 930 nt6.46□□□□□ -1.38
RRN11Q04712 EFM1YHL039W 1758 nt6.46□□□□□ -1.38
RRN11Q04712 PGI1YBR196C 1665 nt6.45□□□□□ -1.38
RRN11Q04712 NUP49YGL172W 1419 nt6.45□□□□□ -1.38
RRN11Q04712 FMO1YHR176W 1299 nt6.45□□□□□ -1.38
RRN11Q04712 GFA1YKL104C 2154 nt6.45□□□□□ -1.38
RRN11Q04712 SUB2YDL084W 1341 nt6.45□□□□□ -1.38
RRN11Q04712 RIX7YLL034C 2514 nt6.44□□□□□ -1.38
RRN11Q04712 YCR049CYCR049C 447 nt6.44□□□□□ -1.38
RRN11Q04712 SAL1YNL083W 1485 nt6.43□□□□□ -1.38
RRN11Q04712 CRH1YGR189C 1524 nt6.43□□□□□ -1.38
RRN11Q04712 GCG1YER163C 699 nt6.42□□□□□ -1.38
RRN11Q04712 YAL045CYAL045C 309 nt6.42□□□□□ -1.38
RRN11Q04712 YPR127WYPR127W 1038 nt6.42□□□□□ -1.38
RRN11Q04712 SMX3YPR182W 261 nt6.42□□□□□ -1.38
RRN11Q04712 MCH2YKL221W 1422 nt6.42□□□□□ -1.38
RRN11Q04712 MSS1YMR023C 1581 nt6.41□□□□□ -1.38
RRN11Q04712 MTR3YGR158C 753 nt6.41□□□□□ -1.38
RRN11Q04712 MDH1YKL085W 1005 nt6.41□□□□□ -1.38
RRN11Q04712 CWC27YPL064C 906 nt6.41□□□□□ -1.38
RRN11Q04712 SNT309YPR101W 528 nt6.41□□□□□ -1.38
RRN11Q04712 CIT3YPR001W 1461 nt6.41□□□□□ -1.38
RRN11Q04712 ICP55YER078C 1536 nt6.4□□□□□ -1.38
RRN11Q04712 PHO85YPL031C 918 nt6.4□□□□□ -1.38
RRN11Q04712 ATG22YCL038C 1587 nt6.4□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 NSE5YML023C 1671 nt6.39□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 CYB2YML054C 1776 nt6.39□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 TFG2YGR005C 1203 nt6.39□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 PRI1YIR008C 1230 nt6.39□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 RNH1YMR234W 1047 nt6.39□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 ARC35YNR035C 1029 nt6.39□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 LSC1YOR142W 990 nt6.39□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 HPT1YDR399W 666 nt6.38□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 SHO1YER118C 1104 nt6.38□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt6.38□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 SWD1YAR003W 1281 nt6.38□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 YMR034CYMR034C 1305 nt6.38□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 TDP1YBR223C 1635 nt6.38□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 SAC6YDR129C 1929 nt6.38□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 MSC3YLR219W 2187 nt6.38□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 AMN1YBR158W 1650 nt6.37□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 CTF8YHR191C 402 nt6.37□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 OM45YIL136W 1182 nt6.37□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 REC107YJR021C 945 nt6.37□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 YBR124WYBR124W 360 nt6.37□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 PRY3YJL078C 2646 nt6.37□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 SKN1YGR143W 2316 nt6.37□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 DLD1YDL174C 1764 nt6.36□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 FYV1YDR024W 486 nt6.36□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 TRP5YGL026C 2124 nt6.36□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 NTG1YAL015C 1200 nt6.36□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 KNS1YLL019C 2214 nt6.35□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 DRE2YKR071C 1047 nt6.35□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 TMA46YOR091W 1038 nt6.35□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 YBR226CYBR226C 411 nt6.35□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 IMA2YOL157C 1770 nt6.35□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 KTR5YNL029C 1569 nt6.35□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 TAH11YJR046W 1815 nt6.34□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 ERS1YCR075C 783 nt6.34□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 MIX17YMR002W 471 nt6.34□□□□□ -1.39
RRN11Q04712 QNS1YHR074W 2145 nt6.34□□□□□ -1.4
RRN11Q04712 YKL102CYKL102C 306 nt6.33□□□□□ -1.4
RRN11Q04712 SPG5YMR191W 1122 nt6.33□□□□□ -1.4
RRN11Q04712 YBR113WYBR113W 483 nt6.33□□□□□ -1.4
RRN11Q04712 YHK8YHR048W 1545 nt6.33□□□□□ -1.4
RRN11Q04712 IRC5YFR038W 2562 nt6.32□□□□□ -1.4
RRN11Q04712 IRS4YKR019C 1848 nt6.32□□□□□ -1.4
RRN11Q04712 HED1YDR014W-A 489 nt6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10 ms