Protein–RNA interactions for Protein: Q03938

ZNF90, Zinc finger protein 90, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF90Q03938 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF90Q03938 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF90Q03938 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF90Q03938 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF90Q03938 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms