Protein–RNA interactions for Protein: Q02100

SKO1, CRE-binding bZIP protein SKO1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKO1Q02100 TAH11YJR046W 1815 nt6.02□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 MPH3YJR160C 1809 nt6.02□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 YCR049CYCR049C 447 nt6.02□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 PET117YER058W 324 nt6.02□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 ARC35YNR035C 1029 nt6.02□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 SLD7YOR060C 774 nt6.02□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 ERG10YPL028W 1197 nt6.02□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 YPR130CYPR130C 408 nt6.02□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 YCL049CYCL049C 939 nt6.02□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 SKI2YLR398C 3864 nt6.02□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 TDP1YBR223C 1635 nt6.02□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt6.01□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 RRN10YBL025W 438 nt6.01□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 GET4YOR164C 939 nt6.01□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 SNT309YPR101W 528 nt6.01□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 MSN2YMR037C 2115 nt6.01□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 MPE1YKL059C 1326 nt6□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 BIO3YNR058W 1443 nt6□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 ERG27YLR100W 1044 nt6□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 DPM1YPR183W 804 nt6□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 AMN1YBR158W 1650 nt6□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 ECM38YLR299W 1983 nt6□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 LAG2YOL025W 1983 nt6□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 FRE5YOR384W 2085 nt6□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 BDF2YDL070W 1917 nt5.99□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 GUF1YLR289W 1938 nt5.99□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 IES1YFL013C 2079 nt5.99□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 SUF3tG(CCC)D 72 nt5.99□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 AVO2YMR068W 1281 nt5.99□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 HXT15YDL245C 1704 nt5.99□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 HXT16YJR158W 1704 nt5.99□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 ECM30YLR436C 3825 nt5.99□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 CEM1YER061C 1329 nt5.99□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 NMT1YLR195C 1368 nt5.98□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 ERS1YCR075C 783 nt5.98□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 MTR3YGR158C 753 nt5.98□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 LDB7YBL006C 543 nt5.98□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 ERG12YMR208W 1332 nt5.98□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 GLN3YER040W 2193 nt5.97□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 CIA1YDR267C 993 nt5.97□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 ERP2YAL007C 648 nt5.97□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 PLB2YMR006C 2121 nt5.97□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 YOL046CYOL046C 675 nt5.97□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 HBN1YCL026C-B 582 nt5.97□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 YPR204WYPR204W 3099 nt5.96□□□□□ -1.45
SKO1Q02100 YJL163CYJL163C 1668 nt5.96□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 YDL023CYDL023C 321 nt5.96□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 RPL2BYIL018W 765 nt5.96□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 YNR014WYNR014W 639 nt5.96□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 HTZ1YOL012C 405 nt5.96□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 YPR127WYPR127W 1038 nt5.96□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 YMR027WYMR027W 1413 nt5.96□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 RSC2YLR357W 2670 nt5.96□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 IRC5YFR038W 2562 nt5.95□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 DMC1YER179W 1005 nt5.95□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt5.95□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 APE4YHR113W 1473 nt5.95□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 MSG5YNL053W 1470 nt5.95□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 CTA1YDR256C 1548 nt5.94□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 YAL045CYAL045C 309 nt5.94□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 CLN1YMR199W 1641 nt5.94□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 COX15YER141W 1461 nt5.94□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 DEF1YKL054C 2217 nt5.94□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 ARP3YJR065C 1350 nt5.93□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 FIT2YOR382W 462 nt5.93□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 YBR241CYBR241C 1467 nt5.93□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 SLX5YDL013W 1860 nt5.93□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 CYS4YGR155W 1524 nt5.93□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 MIX17YMR002W 471 nt5.92□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 RPL43AYPR043W 279 nt5.92□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 TFB4YPR056W 1017 nt5.92□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 MSS116YDR194C 1995 nt5.92□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 BRN1YBL097W 2265 nt5.92□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 EMP65YER140W 1671 nt5.91□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 MRPL28YDR462W 444 nt5.91□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 HSP12YFL014W 330 nt5.91□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 SRY1YKL218C 981 nt5.91□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 YNR005CYNR005C 405 nt5.91□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 DFR1YOR236W 636 nt5.91□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 OPI11YPR044C 354 nt5.91□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 YPR076WYPR076W 375 nt5.91□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 FCY22YER060W-A 1593 nt5.91□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 HOC1YJR075W 1191 nt5.9□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 OPI8YKR035C 642 nt5.9□□□□□ -1.46
SKO1Q02100 RGD2YFL047W 2145 nt5.89□□□□□ -1.47
SKO1Q02100 PPH22YDL188C 1134 nt5.89□□□□□ -1.47
SKO1Q02100 LIA1YJR070C 978 nt5.89□□□□□ -1.47
SKO1Q02100 SUR7YML052W 909 nt5.89□□□□□ -1.47
SKO1Q02100 IRS4YKR019C 1848 nt5.89□□□□□ -1.47
SKO1Q02100 HXT17YNR072W 1695 nt5.88□□□□□ -1.47
SKO1Q02100 PAP1YKR002W 1707 nt5.88□□□□□ -1.47
SKO1Q02100 DLD1YDL174C 1764 nt5.88□□□□□ -1.47
SKO1Q02100 PPH21YDL134C 1110 nt5.88□□□□□ -1.47
SKO1Q02100 TRS31YDR472W 852 nt5.88□□□□□ -1.47
SKO1Q02100 THR1YHR025W 1074 nt5.88□□□□□ -1.47
SKO1Q02100 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt5.88□□□□□ -1.47
SKO1Q02100 ARG81YML099C 2643 nt5.88□□□□□ -1.47
SKO1Q02100 DPB2YPR175W 2070 nt5.87□□□□□ -1.47
SKO1Q02100 AVT4YNL101W 2142 nt5.87□□□□□ -1.47
SKO1Q02100 HPT1YDR399W 666 nt5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.3 ms