Protein–RNA interactions for Protein: Q01546

KRT76, Keratin, type II cytoskeletal 2 oral, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT76Q01546 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT76Q01546 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT76Q01546 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT76Q01546 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT76Q01546 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT76Q01546 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT76Q01546 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT76Q01546 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT76Q01546 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT76Q01546 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT76Q01546 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT76Q01546 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT76Q01546 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT76Q01546 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT76Q01546 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT76Q01546 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT76Q01546 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT76Q01546 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT76Q01546 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT76Q01546 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT76Q01546 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT76Q01546 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT76Q01546 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT76Q01546 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT76Q01546 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT76Q01546 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT76Q01546 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
KRT76Q01546 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT76Q01546 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT76Q01546 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT76Q01546 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KRT76Q01546 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KRT76Q01546 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT76Q01546 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT76Q01546 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT76Q01546 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT76Q01546 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT76Q01546 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT76Q01546 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT76Q01546 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT76Q01546 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT76Q01546 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.55■■■□□ 2
KRT76Q01546 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT76Q01546 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT76Q01546 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT76Q01546 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT76Q01546 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT76Q01546 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT76Q01546 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT76Q01546 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT76Q01546 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT76Q01546 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT76Q01546 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT76Q01546 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KRT76Q01546 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT76Q01546 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT76Q01546 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT76Q01546 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT76Q01546 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT76Q01546 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT76Q01546 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT76Q01546 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT76Q01546 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT76Q01546 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT76Q01546 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT76Q01546 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT76Q01546 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT76Q01546 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT76Q01546 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT76Q01546 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT76Q01546 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT76Q01546 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT76Q01546 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT76Q01546 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT76Q01546 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT76Q01546 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT76Q01546 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT76Q01546 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT76Q01546 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT76Q01546 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT76Q01546 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT76Q01546 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT76Q01546 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT76Q01546 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRT76Q01546 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRT76Q01546 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT76Q01546 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT76Q01546 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT76Q01546 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT76Q01546 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT76Q01546 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT76Q01546 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT76Q01546 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT76Q01546 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT76Q01546 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT76Q01546 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT76Q01546 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT76Q01546 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT76Q01546 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT76Q01546 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms