Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCCQ00597 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCCQ00597 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCCQ00597 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCCQ00597 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCCQ00597 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCCQ00597 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCCQ00597 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCCQ00597 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCCQ00597 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCCQ00597 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCCQ00597 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCCQ00597 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
FANCCQ00597 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCCQ00597 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCCQ00597 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCCQ00597 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCCQ00597 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCCQ00597 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCCQ00597 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCCQ00597 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCCQ00597 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCCQ00597 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCCQ00597 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCCQ00597 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCCQ00597 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCCQ00597 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCCQ00597 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCCQ00597 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCCQ00597 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCCQ00597 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCCQ00597 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCCQ00597 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCCQ00597 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCCQ00597 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FANCCQ00597 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCCQ00597 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCCQ00597 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCCQ00597 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCCQ00597 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCCQ00597 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCCQ00597 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCCQ00597 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCCQ00597 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FANCCQ00597 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FANCCQ00597 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FANCCQ00597 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FANCCQ00597 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FANCCQ00597 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FANCCQ00597 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FANCCQ00597 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FANCCQ00597 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FANCCQ00597 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FANCCQ00597 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FANCCQ00597 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FANCCQ00597 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FANCCQ00597 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FANCCQ00597 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FANCCQ00597 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
FANCCQ00597 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FANCCQ00597 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms