Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK17Q00537 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK17Q00537 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK17Q00537 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK17Q00537 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK17Q00537 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK17Q00537 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK17Q00537 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK17Q00537 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK17Q00537 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK17Q00537 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK17Q00537 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK17Q00537 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK17Q00537 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK17Q00537 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK17Q00537 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK17Q00537 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK17Q00537 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK17Q00537 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK17Q00537 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK17Q00537 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK17Q00537 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK17Q00537 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK17Q00537 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK17Q00537 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK17Q00537 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK17Q00537 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK17Q00537 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK17Q00537 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK17Q00537 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK17Q00537 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK17Q00537 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CDK17Q00537 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CDK17Q00537 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK17Q00537 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK17Q00537 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK17Q00537 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK17Q00537 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK17Q00537 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK17Q00537 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK17Q00537 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK17Q00537 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK17Q00537 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK17Q00537 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK17Q00537 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK17Q00537 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK17Q00537 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK17Q00537 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK17Q00537 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK17Q00537 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK17Q00537 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK17Q00537 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK17Q00537 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK17Q00537 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK17Q00537 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK17Q00537 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK17Q00537 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK17Q00537 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK17Q00537 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK17Q00537 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK17Q00537 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK17Q00537 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK17Q00537 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK17Q00537 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK17Q00537 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CDK17Q00537 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK17Q00537 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK17Q00537 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK17Q00537 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK17Q00537 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK17Q00537 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK17Q00537 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK17Q00537 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms