Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZBED6P86452 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZBED6P86452 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZBED6P86452 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED6P86452 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED6P86452 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED6P86452 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED6P86452 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED6P86452 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZBED6P86452 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ZBED6P86452 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZBED6P86452 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZBED6P86452 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZBED6P86452 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZBED6P86452 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZBED6P86452 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED6P86452 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED6P86452 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED6P86452 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED6P86452 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED6P86452 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED6P86452 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED6P86452 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED6P86452 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZBED6P86452 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZBED6P86452 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZBED6P86452 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED6P86452 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED6P86452 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED6P86452 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED6P86452 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED6P86452 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED6P86452 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED6P86452 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED6P86452 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED6P86452 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED6P86452 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED6P86452 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED6P86452 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED6P86452 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED6P86452 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED6P86452 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED6P86452 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED6P86452 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED6P86452 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZBED6P86452 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED6P86452 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED6P86452 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED6P86452 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZBED6P86452 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZBED6P86452 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ZBED6P86452 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED6P86452 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED6P86452 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED6P86452 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED6P86452 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED6P86452 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED6P86452 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED6P86452 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED6P86452 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED6P86452 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED6P86452 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms