Protein–RNA interactions for Protein: P82663

MRPS25, 28S ribosomal protein S25, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS25P82663 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPS25P82663 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPS25P82663 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPS25P82663 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPS25P82663 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPS25P82663 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPS25P82663 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPS25P82663 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPS25P82663 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPS25P82663 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPS25P82663 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPS25P82663 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPS25P82663 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPS25P82663 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPS25P82663 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRPS25P82663 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms