Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CRB1P82279 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CRB1P82279 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CRB1P82279 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CRB1P82279 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CRB1P82279 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CRB1P82279 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CRB1P82279 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CRB1P82279 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CRB1P82279 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CRB1P82279 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CRB1P82279 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CRB1P82279 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CRB1P82279 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CRB1P82279 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CRB1P82279 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CRB1P82279 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CRB1P82279 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CRB1P82279 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CRB1P82279 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CRB1P82279 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
CRB1P82279 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CRB1P82279 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CRB1P82279 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CRB1P82279 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
CRB1P82279 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
CRB1P82279 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CRB1P82279 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CRB1P82279 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CRB1P82279 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CRB1P82279 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CRB1P82279 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CRB1P82279 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CRB1P82279 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CRB1P82279 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CRB1P82279 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CRB1P82279 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CRB1P82279 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CRB1P82279 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CRB1P82279 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CRB1P82279 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CRB1P82279 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CRB1P82279 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CRB1P82279 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CRB1P82279 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CRB1P82279 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CRB1P82279 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CRB1P82279 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CRB1P82279 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CRB1P82279 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CRB1P82279 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CRB1P82279 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CRB1P82279 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CRB1P82279 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CRB1P82279 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CRB1P82279 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
CRB1P82279 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
CRB1P82279 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CRB1P82279 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CRB1P82279 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CRB1P82279 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CRB1P82279 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CRB1P82279 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CRB1P82279 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CRB1P82279 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CRB1P82279 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CRB1P82279 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CRB1P82279 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CRB1P82279 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
CRB1P82279 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CRB1P82279 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CRB1P82279 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CRB1P82279 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CRB1P82279 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CRB1P82279 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CRB1P82279 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CRB1P82279 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CRB1P82279 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CRB1P82279 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CRB1P82279 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CRB1P82279 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CRB1P82279 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CRB1P82279 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CRB1P82279 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CRB1P82279 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CRB1P82279 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CRB1P82279 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CRB1P82279 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CRB1P82279 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CRB1P82279 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CRB1P82279 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CRB1P82279 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CRB1P82279 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CRB1P82279 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CRB1P82279 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CRB1P82279 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CRB1P82279 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CRB1P82279 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CRB1P82279 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CRB1P82279 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms