Protein–RNA interactions for Protein: P78560

CRADD, Death domain-containing protein CRADD, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRADDP78560 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CRADDP78560 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRADDP78560 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRADDP78560 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRADDP78560 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRADDP78560 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRADDP78560 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRADDP78560 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRADDP78560 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRADDP78560 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRADDP78560 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRADDP78560 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRADDP78560 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRADDP78560 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRADDP78560 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRADDP78560 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRADDP78560 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRADDP78560 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRADDP78560 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRADDP78560 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRADDP78560 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRADDP78560 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRADDP78560 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CRADDP78560 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CRADDP78560 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRADDP78560 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRADDP78560 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRADDP78560 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRADDP78560 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRADDP78560 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRADDP78560 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRADDP78560 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRADDP78560 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRADDP78560 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRADDP78560 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRADDP78560 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRADDP78560 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRADDP78560 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CRADDP78560 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CRADDP78560 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRADDP78560 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRADDP78560 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRADDP78560 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRADDP78560 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRADDP78560 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRADDP78560 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRADDP78560 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRADDP78560 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRADDP78560 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRADDP78560 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRADDP78560 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRADDP78560 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRADDP78560 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CRADDP78560 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRADDP78560 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRADDP78560 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRADDP78560 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRADDP78560 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CRADDP78560 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRADDP78560 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRADDP78560 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRADDP78560 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRADDP78560 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRADDP78560 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRADDP78560 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRADDP78560 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRADDP78560 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRADDP78560 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRADDP78560 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRADDP78560 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRADDP78560 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRADDP78560 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRADDP78560 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRADDP78560 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRADDP78560 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRADDP78560 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRADDP78560 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CRADDP78560 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRADDP78560 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRADDP78560 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CRADDP78560 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRADDP78560 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRADDP78560 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRADDP78560 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRADDP78560 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRADDP78560 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRADDP78560 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRADDP78560 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRADDP78560 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRADDP78560 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRADDP78560 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRADDP78560 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRADDP78560 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRADDP78560 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRADDP78560 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRADDP78560 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CRADDP78560 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRADDP78560 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRADDP78560 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRADDP78560 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms