Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IRX3P78415 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRX3P78415 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRX3P78415 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRX3P78415 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRX3P78415 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRX3P78415 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRX3P78415 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRX3P78415 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRX3P78415 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IRX3P78415 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IRX3P78415 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
IRX3P78415 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRX3P78415 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRX3P78415 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRX3P78415 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRX3P78415 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRX3P78415 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRX3P78415 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
IRX3P78415 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRX3P78415 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRX3P78415 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IRX3P78415 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
IRX3P78415 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
IRX3P78415 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IRX3P78415 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IRX3P78415 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IRX3P78415 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IRX3P78415 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IRX3P78415 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IRX3P78415 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IRX3P78415 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IRX3P78415 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IRX3P78415 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IRX3P78415 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRX3P78415 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRX3P78415 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRX3P78415 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IRX3P78415 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IRX3P78415 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IRX3P78415 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IRX3P78415 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IRX3P78415 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IRX3P78415 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRX3P78415 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRX3P78415 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRX3P78415 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRX3P78415 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRX3P78415 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IRX3P78415 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IRX3P78415 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IRX3P78415 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
IRX3P78415 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRX3P78415 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRX3P78415 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRX3P78415 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
IRX3P78415 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRX3P78415 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IRX3P78415 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IRX3P78415 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IRX3P78415 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
IRX3P78415 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IRX3P78415 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRX3P78415 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRX3P78415 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRX3P78415 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRX3P78415 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRX3P78415 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRX3P78415 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRX3P78415 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRX3P78415 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRX3P78415 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRX3P78415 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRX3P78415 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRX3P78415 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IRX3P78415 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IRX3P78415 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IRX3P78415 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IRX3P78415 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IRX3P78415 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IRX3P78415 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IRX3P78415 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IRX3P78415 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRX3P78415 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRX3P78415 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRX3P78415 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRX3P78415 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRX3P78415 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRX3P78415 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRX3P78415 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
IRX3P78415 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
IRX3P78415 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
IRX3P78415 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IRX3P78415 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IRX3P78415 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IRX3P78415 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRX3P78415 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRX3P78415 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRX3P78415 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IRX3P78415 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms