Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3BP2P78314 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3BP2P78314 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3BP2P78314 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3BP2P78314 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3BP2P78314 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3BP2P78314 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3BP2P78314 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3BP2P78314 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3BP2P78314 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3BP2P78314 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3BP2P78314 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3BP2P78314 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3BP2P78314 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3BP2P78314 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3BP2P78314 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3BP2P78314 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3BP2P78314 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3BP2P78314 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3BP2P78314 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3BP2P78314 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3BP2P78314 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3BP2P78314 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3BP2P78314 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3BP2P78314 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3BP2P78314 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3BP2P78314 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3BP2P78314 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3BP2P78314 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3BP2P78314 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SH3BP2P78314 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SH3BP2P78314 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3BP2P78314 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3BP2P78314 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3BP2P78314 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3BP2P78314 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2P78314 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2P78314 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2P78314 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2P78314 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2P78314 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2P78314 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2P78314 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2P78314 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2P78314 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2P78314 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2P78314 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2P78314 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2P78314 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2P78314 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2P78314 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2P78314 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2P78314 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2P78314 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2P78314 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2P78314 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2P78314 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2P78314 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2P78314 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3BP2P78314 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3BP2P78314 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3BP2P78314 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3BP2P78314 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3BP2P78314 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3BP2P78314 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3BP2P78314 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3BP2P78314 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3BP2P78314 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3BP2P78314 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3BP2P78314 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3BP2P78314 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3BP2P78314 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3BP2P78314 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3BP2P78314 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3BP2P78314 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3BP2P78314 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3BP2P78314 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2P78314 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2P78314 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2P78314 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2P78314 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2P78314 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3BP2P78314 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3BP2P78314 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3BP2P78314 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3BP2P78314 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3BP2P78314 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3BP2P78314 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3BP2P78314 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SH3BP2P78314 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2P78314 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2P78314 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2P78314 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2P78314 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2P78314 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2P78314 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2P78314 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3BP2P78314 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3BP2P78314 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3BP2P78314 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms