Protein–RNA interactions for Protein: P69891

HBG1, Hemoglobin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBG1P69891 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HBG1P69891 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HBG1P69891 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
HBG1P69891 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HBG1P69891 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HBG1P69891 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HBG1P69891 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HBG1P69891 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HBG1P69891 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HBG1P69891 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HBG1P69891 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HBG1P69891 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HBG1P69891 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HBG1P69891 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HBG1P69891 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HBG1P69891 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HBG1P69891 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HBG1P69891 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HBG1P69891 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HBG1P69891 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HBG1P69891 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HBG1P69891 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HBG1P69891 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HBG1P69891 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HBG1P69891 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HBG1P69891 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HBG1P69891 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HBG1P69891 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HBG1P69891 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HBG1P69891 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HBG1P69891 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HBG1P69891 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HBG1P69891 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HBG1P69891 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HBG1P69891 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HBG1P69891 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HBG1P69891 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HBG1P69891 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HBG1P69891 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HBG1P69891 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HBG1P69891 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HBG1P69891 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HBG1P69891 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HBG1P69891 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HBG1P69891 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HBG1P69891 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HBG1P69891 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HBG1P69891 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HBG1P69891 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HBG1P69891 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HBG1P69891 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HBG1P69891 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HBG1P69891 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HBG1P69891 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HBG1P69891 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HBG1P69891 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HBG1P69891 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HBG1P69891 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HBG1P69891 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HBG1P69891 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HBG1P69891 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HBG1P69891 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HBG1P69891 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HBG1P69891 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HBG1P69891 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HBG1P69891 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HBG1P69891 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HBG1P69891 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HBG1P69891 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HBG1P69891 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HBG1P69891 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HBG1P69891 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HBG1P69891 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HBG1P69891 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HBG1P69891 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HBG1P69891 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HBG1P69891 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HBG1P69891 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HBG1P69891 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HBG1P69891 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HBG1P69891 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HBG1P69891 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HBG1P69891 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HBG1P69891 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HBG1P69891 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HBG1P69891 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HBG1P69891 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HBG1P69891 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HBG1P69891 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HBG1P69891 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HBG1P69891 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HBG1P69891 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HBG1P69891 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HBG1P69891 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HBG1P69891 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HBG1P69891 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HBG1P69891 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HBG1P69891 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HBG1P69891 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HBG1P69891 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms