Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBB4BP68371 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBB4BP68371 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBB4BP68371 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBB4BP68371 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBB4BP68371 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBB4BP68371 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBB4BP68371 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBB4BP68371 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBB4BP68371 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBB4BP68371 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBB4BP68371 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBB4BP68371 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBB4BP68371 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBB4BP68371 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TUBB4BP68371 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBB4BP68371 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBB4BP68371 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBB4BP68371 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBB4BP68371 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBB4BP68371 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBB4BP68371 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBB4BP68371 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBB4BP68371 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBB4BP68371 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBB4BP68371 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBB4BP68371 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBB4BP68371 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBB4BP68371 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBB4BP68371 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBB4BP68371 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBB4BP68371 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBB4BP68371 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBB4BP68371 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBB4BP68371 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBB4BP68371 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBB4BP68371 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBB4BP68371 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBB4BP68371 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBB4BP68371 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBB4BP68371 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBB4BP68371 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBB4BP68371 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBB4BP68371 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TUBB4BP68371 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBB4BP68371 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBB4BP68371 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBB4BP68371 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBB4BP68371 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBB4BP68371 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBB4BP68371 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBB4BP68371 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBB4BP68371 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBB4BP68371 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBB4BP68371 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBB4BP68371 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBB4BP68371 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBB4BP68371 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBB4BP68371 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBB4BP68371 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBB4BP68371 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBB4BP68371 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBB4BP68371 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBB4BP68371 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBB4BP68371 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBB4BP68371 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBB4BP68371 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBB4BP68371 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 230.1 ms