Protein–RNA interactions for Protein: P63316

TNNC1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC1P63316 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNC1P63316 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNC1P63316 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNC1P63316 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNC1P63316 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNC1P63316 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNC1P63316 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNC1P63316 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNC1P63316 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNC1P63316 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNC1P63316 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNC1P63316 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNC1P63316 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNC1P63316 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNC1P63316 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNC1P63316 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNC1P63316 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNC1P63316 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNC1P63316 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNC1P63316 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNC1P63316 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNC1P63316 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNC1P63316 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNC1P63316 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNC1P63316 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNNC1P63316 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNC1P63316 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNC1P63316 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNC1P63316 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNC1P63316 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNC1P63316 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNC1P63316 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNC1P63316 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNC1P63316 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNC1P63316 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNC1P63316 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNC1P63316 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNC1P63316 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNC1P63316 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNC1P63316 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNC1P63316 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNC1P63316 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNC1P63316 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNC1P63316 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNC1P63316 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNC1P63316 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNC1P63316 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNC1P63316 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNC1P63316 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNC1P63316 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNC1P63316 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNNC1P63316 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNNC1P63316 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNNC1P63316 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNNC1P63316 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNNC1P63316 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNNC1P63316 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNNC1P63316 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNC1P63316 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNC1P63316 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNC1P63316 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNC1P63316 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNC1P63316 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNC1P63316 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNC1P63316 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNC1P63316 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNC1P63316 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNC1P63316 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNC1P63316 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNC1P63316 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNC1P63316 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNNC1P63316 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNNC1P63316 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TNNC1P63316 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNNC1P63316 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNNC1P63316 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TNNC1P63316 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNC1P63316 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNC1P63316 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNC1P63316 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNC1P63316 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNC1P63316 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNC1P63316 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNC1P63316 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNC1P63316 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNC1P63316 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNC1P63316 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNC1P63316 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNC1P63316 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNC1P63316 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNC1P63316 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNC1P63316 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNC1P63316 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNC1P63316 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNC1P63316 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNC1P63316 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNC1P63316 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNC1P63316 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNC1P63316 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNC1P63316 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms