Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVK-21P61565 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVK-21P61565 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVK-21P61565 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVK-21P61565 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVK-21P61565 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVK-21P61565 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVK-21P61565 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVK-21P61565 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVK-21P61565 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVK-21P61565 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVK-21P61565 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVK-21P61565 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVK-21P61565 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVK-21P61565 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVK-21P61565 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVK-21P61565 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVK-21P61565 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVK-21P61565 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVK-21P61565 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVK-21P61565 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVK-21P61565 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVK-21P61565 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVK-21P61565 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVK-21P61565 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVK-21P61565 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVK-21P61565 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVK-21P61565 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVK-21P61565 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVK-21P61565 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVK-21P61565 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVK-21P61565 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVK-21P61565 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVK-21P61565 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVK-21P61565 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVK-21P61565 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVK-21P61565 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVK-21P61565 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVK-21P61565 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVK-21P61565 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVK-21P61565 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVK-21P61565 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVK-21P61565 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVK-21P61565 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVK-21P61565 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVK-21P61565 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVK-21P61565 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVK-21P61565 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVK-21P61565 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVK-21P61565 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVK-21P61565 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVK-21P61565 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVK-21P61565 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVK-21P61565 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVK-21P61565 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVK-21P61565 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVK-21P61565 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVK-21P61565 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVK-21P61565 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVK-21P61565 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVK-21P61565 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVK-21P61565 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVK-21P61565 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVK-21P61565 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVK-21P61565 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVK-21P61565 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVK-21P61565 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVK-21P61565 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVK-21P61565 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVK-21P61565 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVK-21P61565 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVK-21P61565 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVK-21P61565 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVK-21P61565 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVK-21P61565 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVK-21P61565 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVK-21P61565 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVK-21P61565 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVK-21P61565 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVK-21P61565 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVK-21P61565 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVK-21P61565 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVK-21P61565 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVK-21P61565 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVK-21P61565 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVK-21P61565 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVK-21P61565 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVK-21P61565 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVK-21P61565 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVK-21P61565 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVK-21P61565 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVK-21P61565 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVK-21P61565 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVK-21P61565 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVK-21P61565 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVK-21P61565 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVK-21P61565 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVK-21P61565 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVK-21P61565 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVK-21P61565 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms