Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVPABLB-1P60509 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVPABLB-1P60509 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVPABLB-1P60509 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVPABLB-1P60509 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVPABLB-1P60509 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVPABLB-1P60509 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVPABLB-1P60509 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVPABLB-1P60509 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVPABLB-1P60509 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVPABLB-1P60509 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVPABLB-1P60509 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVPABLB-1P60509 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVPABLB-1P60509 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVPABLB-1P60509 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVPABLB-1P60509 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVPABLB-1P60509 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVPABLB-1P60509 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVPABLB-1P60509 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVPABLB-1P60509 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVPABLB-1P60509 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVPABLB-1P60509 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVPABLB-1P60509 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVPABLB-1P60509 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERVPABLB-1P60509 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVPABLB-1P60509 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVPABLB-1P60509 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVPABLB-1P60509 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVPABLB-1P60509 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVPABLB-1P60509 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVPABLB-1P60509 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVPABLB-1P60509 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVPABLB-1P60509 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVPABLB-1P60509 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVPABLB-1P60509 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVPABLB-1P60509 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVPABLB-1P60509 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVPABLB-1P60509 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVPABLB-1P60509 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVPABLB-1P60509 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVPABLB-1P60509 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVPABLB-1P60509 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVPABLB-1P60509 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVPABLB-1P60509 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVPABLB-1P60509 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVPABLB-1P60509 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVPABLB-1P60509 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVPABLB-1P60509 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVPABLB-1P60509 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVPABLB-1P60509 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVPABLB-1P60509 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVPABLB-1P60509 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVPABLB-1P60509 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVPABLB-1P60509 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVPABLB-1P60509 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVPABLB-1P60509 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVPABLB-1P60509 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVPABLB-1P60509 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVPABLB-1P60509 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVPABLB-1P60509 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVPABLB-1P60509 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVPABLB-1P60509 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms