Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GSCP56915 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GSCP56915 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GSCP56915 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GSCP56915 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GSCP56915 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GSCP56915 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GSCP56915 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GSCP56915 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GSCP56915 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GSCP56915 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GSCP56915 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GSCP56915 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GSCP56915 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GSCP56915 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GSCP56915 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GSCP56915 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GSCP56915 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GSCP56915 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GSCP56915 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GSCP56915 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GSCP56915 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GSCP56915 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GSCP56915 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GSCP56915 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GSCP56915 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GSCP56915 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GSCP56915 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GSCP56915 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GSCP56915 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GSCP56915 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GSCP56915 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GSCP56915 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GSCP56915 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GSCP56915 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GSCP56915 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GSCP56915 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GSCP56915 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GSCP56915 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GSCP56915 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GSCP56915 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GSCP56915 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GSCP56915 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GSCP56915 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GSCP56915 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GSCP56915 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GSCP56915 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GSCP56915 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GSCP56915 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GSCP56915 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GSCP56915 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GSCP56915 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GSCP56915 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GSCP56915 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GSCP56915 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GSCP56915 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GSCP56915 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GSCP56915 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GSCP56915 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GSCP56915 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GSCP56915 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GSCP56915 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GSCP56915 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GSCP56915 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GSCP56915 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GSCP56915 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GSCP56915 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GSCP56915 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GSCP56915 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GSCP56915 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GSCP56915 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GSCP56915 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GSCP56915 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GSCP56915 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GSCP56915 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GSCP56915 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GSCP56915 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GSCP56915 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GSCP56915 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GSCP56915 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GSCP56915 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GSCP56915 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GSCP56915 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GSCP56915 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GSCP56915 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GSCP56915 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GSCP56915 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GSCP56915 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GSCP56915 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSCP56915 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSCP56915 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSCP56915 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSCP56915 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSCP56915 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GSCP56915 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GSCP56915 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GSCP56915 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GSCP56915 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GSCP56915 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GSCP56915 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms