Protein–RNA interactions for Protein: P56559

ARL4C, ADP-ribosylation factor-like protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4CP56559 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARL4CP56559 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARL4CP56559 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARL4CP56559 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARL4CP56559 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARL4CP56559 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARL4CP56559 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARL4CP56559 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARL4CP56559 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARL4CP56559 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARL4CP56559 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARL4CP56559 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARL4CP56559 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARL4CP56559 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARL4CP56559 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARL4CP56559 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ARL4CP56559 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARL4CP56559 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARL4CP56559 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARL4CP56559 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARL4CP56559 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARL4CP56559 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARL4CP56559 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ARL4CP56559 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ARL4CP56559 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ARL4CP56559 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ARL4CP56559 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ARL4CP56559 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ARL4CP56559 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ARL4CP56559 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ARL4CP56559 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ARL4CP56559 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms