Protein–RNA interactions for Protein: P55289

CDH12, Cadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH12P55289 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH12P55289 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH12P55289 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH12P55289 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH12P55289 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH12P55289 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH12P55289 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH12P55289 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH12P55289 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH12P55289 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH12P55289 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH12P55289 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH12P55289 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH12P55289 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH12P55289 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH12P55289 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH12P55289 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH12P55289 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH12P55289 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH12P55289 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH12P55289 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH12P55289 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH12P55289 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH12P55289 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH12P55289 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH12P55289 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH12P55289 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH12P55289 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH12P55289 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH12P55289 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH12P55289 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH12P55289 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH12P55289 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH12P55289 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH12P55289 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH12P55289 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH12P55289 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH12P55289 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH12P55289 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH12P55289 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH12P55289 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH12P55289 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH12P55289 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH12P55289 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH12P55289 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH12P55289 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH12P55289 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH12P55289 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH12P55289 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH12P55289 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH12P55289 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH12P55289 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH12P55289 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH12P55289 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH12P55289 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH12P55289 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH12P55289 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH12P55289 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH12P55289 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH12P55289 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH12P55289 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH12P55289 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH12P55289 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH12P55289 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH12P55289 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH12P55289 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH12P55289 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH12P55289 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH12P55289 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH12P55289 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH12P55289 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH12P55289 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH12P55289 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH12P55289 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH12P55289 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH12P55289 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH12P55289 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH12P55289 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH12P55289 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH12P55289 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH12P55289 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH12P55289 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH12P55289 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH12P55289 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH12P55289 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH12P55289 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH12P55289 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH12P55289 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH12P55289 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH12P55289 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH12P55289 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH12P55289 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH12P55289 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH12P55289 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH12P55289 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH12P55289 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH12P55289 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH12P55289 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH12P55289 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH12P55289 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms