Protein–RNA interactions for Protein: P53990

IST1, IST1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IST1P53990 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IST1P53990 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IST1P53990 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IST1P53990 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IST1P53990 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IST1P53990 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IST1P53990 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IST1P53990 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IST1P53990 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IST1P53990 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IST1P53990 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IST1P53990 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IST1P53990 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IST1P53990 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IST1P53990 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
IST1P53990 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
IST1P53990 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IST1P53990 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IST1P53990 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IST1P53990 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IST1P53990 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IST1P53990 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IST1P53990 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IST1P53990 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IST1P53990 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IST1P53990 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IST1P53990 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IST1P53990 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IST1P53990 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IST1P53990 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IST1P53990 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IST1P53990 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IST1P53990 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IST1P53990 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IST1P53990 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IST1P53990 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IST1P53990 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IST1P53990 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IST1P53990 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IST1P53990 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IST1P53990 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IST1P53990 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IST1P53990 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IST1P53990 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IST1P53990 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IST1P53990 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IST1P53990 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IST1P53990 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IST1P53990 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IST1P53990 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IST1P53990 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IST1P53990 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IST1P53990 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IST1P53990 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IST1P53990 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IST1P53990 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IST1P53990 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IST1P53990 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IST1P53990 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IST1P53990 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IST1P53990 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IST1P53990 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IST1P53990 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IST1P53990 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IST1P53990 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IST1P53990 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IST1P53990 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IST1P53990 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IST1P53990 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IST1P53990 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IST1P53990 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IST1P53990 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IST1P53990 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IST1P53990 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IST1P53990 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IST1P53990 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IST1P53990 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IST1P53990 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IST1P53990 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IST1P53990 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IST1P53990 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IST1P53990 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IST1P53990 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IST1P53990 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IST1P53990 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IST1P53990 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IST1P53990 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IST1P53990 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IST1P53990 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IST1P53990 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IST1P53990 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IST1P53990 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IST1P53990 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IST1P53990 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IST1P53990 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IST1P53990 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IST1P53990 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IST1P53990 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IST1P53990 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IST1P53990 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms