Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPAP53621 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPAP53621 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPAP53621 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPAP53621 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPAP53621 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPAP53621 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPAP53621 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPAP53621 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPAP53621 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPAP53621 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPAP53621 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPAP53621 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
COPAP53621 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPAP53621 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
COPAP53621 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPAP53621 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPAP53621 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPAP53621 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPAP53621 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPAP53621 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
COPAP53621 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPAP53621 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPAP53621 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPAP53621 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPAP53621 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPAP53621 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPAP53621 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPAP53621 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPAP53621 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
COPAP53621 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPAP53621 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
COPAP53621 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
COPAP53621 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPAP53621 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPAP53621 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPAP53621 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPAP53621 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPAP53621 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPAP53621 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPAP53621 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COPAP53621 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COPAP53621 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COPAP53621 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COPAP53621 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COPAP53621 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
COPAP53621 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPAP53621 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPAP53621 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPAP53621 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPAP53621 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPAP53621 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPAP53621 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COPAP53621 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPAP53621 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPAP53621 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPAP53621 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPAP53621 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPAP53621 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
COPAP53621 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPAP53621 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPAP53621 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPAP53621 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPAP53621 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPAP53621 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPAP53621 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPAP53621 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPAP53621 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPAP53621 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
COPAP53621 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPAP53621 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPAP53621 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
COPAP53621 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPAP53621 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPAP53621 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPAP53621 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPAP53621 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPAP53621 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPAP53621 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPAP53621 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPAP53621 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPAP53621 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPAP53621 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
COPAP53621 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPAP53621 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPAP53621 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPAP53621 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPAP53621 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPAP53621 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPAP53621 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPAP53621 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPAP53621 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPAP53621 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPAP53621 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPAP53621 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
COPAP53621 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPAP53621 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPAP53621 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPAP53621 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPAP53621 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms