Protein–RNA interactions for Protein: P53127

SNT2, E3 ubiquitin-protein ligase SNT2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNT2P53127 TDP1YBR223C 1635 nt9.72□□□□□ -0.85
SNT2P53127 RMD8YFR048W 1989 nt9.71□□□□□ -0.86
SNT2P53127 FLC2YAL053W 2352 nt9.7□□□□□ -0.86
SNT2P53127 LYS1YIR034C 1122 nt9.7□□□□□ -0.86
SNT2P53127 TSR3YOR006C 942 nt9.7□□□□□ -0.86
SNT2P53127 MRPL28YDR462W 444 nt9.68□□□□□ -0.86
SNT2P53127 HEM2YGL040C 1029 nt9.68□□□□□ -0.86
SNT2P53127 YBR241CYBR241C 1467 nt9.68□□□□□ -0.86
SNT2P53127 COX10YPL172C 1389 nt9.67□□□□□ -0.86
SNT2P53127 CAN1YEL063C 1773 nt9.67□□□□□ -0.86
SNT2P53127 TRS31YDR472W 852 nt9.67□□□□□ -0.86
SNT2P53127 YJR146WYJR146W 354 nt9.67□□□□□ -0.86
SNT2P53127 STT3YGL022W 2157 nt9.67□□□□□ -0.86
SNT2P53127 ARE2YNR019W 1929 nt9.67□□□□□ -0.86
SNT2P53127 YGR054WYGR054W 1929 nt9.67□□□□□ -0.86
SNT2P53127 POX1YGL205W 2247 nt9.66□□□□□ -0.86
SNT2P53127 YDR015CYDR015C 240 nt9.66□□□□□ -0.86
SNT2P53127 MTC2YKL098W 1074 nt9.66□□□□□ -0.86
SNT2P53127 UTP4YDR324C 2331 nt9.66□□□□□ -0.86
SNT2P53127 FAL1YDR021W 1200 nt9.65□□□□□ -0.86
SNT2P53127 GON7YJL184W 372 nt9.65□□□□□ -0.86
SNT2P53127 YJR154WYJR154W 1041 nt9.65□□□□□ -0.86
SNT2P53127 AAT2YLR027C 1257 nt9.65□□□□□ -0.86
SNT2P53127 RPL10YLR075W 666 nt9.65□□□□□ -0.86
SNT2P53127 PAC2YER007W 1557 nt9.65□□□□□ -0.86
SNT2P53127 GCV3YAL044C 513 nt9.65□□□□□ -0.87
SNT2P53127 RUF23RUF23 254 nt9.65□□□□□ -0.87
SNT2P53127 YPL257WYPL257W 582 nt9.65□□□□□ -0.87
SNT2P53127 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt9.64□□□□□ -0.87
SNT2P53127 SUF16tG(GCC)C 71 nt9.64□□□□□ -0.87
SNT2P53127 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt9.64□□□□□ -0.87
SNT2P53127 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt9.64□□□□□ -0.87
SNT2P53127 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt9.64□□□□□ -0.87
SNT2P53127 SUF20tG(GCC)F1 71 nt9.64□□□□□ -0.87
SNT2P53127 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt9.64□□□□□ -0.87
SNT2P53127 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt9.64□□□□□ -0.87
SNT2P53127 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt9.64□□□□□ -0.87
SNT2P53127 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt9.64□□□□□ -0.87
SNT2P53127 SUF23tG(GCC)J2 71 nt9.64□□□□□ -0.87
SNT2P53127 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt9.64□□□□□ -0.87
SNT2P53127 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt9.64□□□□□ -0.87
SNT2P53127 SUF17tG(GCC)O2 71 nt9.64□□□□□ -0.87
SNT2P53127 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt9.64□□□□□ -0.87
SNT2P53127 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt9.64□□□□□ -0.87
SNT2P53127 PPT1YGR123C 1542 nt9.64□□□□□ -0.87
SNT2P53127 HXK1YFR053C 1458 nt9.63□□□□□ -0.87
SNT2P53127 HXT9YJL219W 1704 nt9.63□□□□□ -0.87
SNT2P53127 snR82snR82 268 nt9.63□□□□□ -0.87
SNT2P53127 GTO3YMR251W 1101 nt9.62□□□□□ -0.87
SNT2P53127 KSH1YNL024C-A 219 nt9.62□□□□□ -0.87
SNT2P53127 RFC4YOL094C 972 nt9.62□□□□□ -0.87
SNT2P53127 SNT309YPR101W 528 nt9.62□□□□□ -0.87
SNT2P53127 MNS1YJR131W 1650 nt9.61□□□□□ -0.87
SNT2P53127 DFM1YDR411C 1026 nt9.61□□□□□ -0.87
SNT2P53127 CCC2YDR270W 3015 nt9.6□□□□□ -0.87
SNT2P53127 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt9.59□□□□□ -0.87
SNT2P53127 IRC11YOR013W 471 nt9.59□□□□□ -0.87
SNT2P53127 SKS1YPL026C 1509 nt9.58□□□□□ -0.88
SNT2P53127 YNL285WYNL285W 372 nt9.57□□□□□ -0.88
SNT2P53127 YJR084WYJR084W 1272 nt9.56□□□□□ -0.88
SNT2P53127 ECM14YHR132C 1293 nt9.56□□□□□ -0.88
SNT2P53127 MHP1YJL042W 4197 nt9.56□□□□□ -0.88
SNT2P53127 EDE1YBL047C 4146 nt9.55□□□□□ -0.88
SNT2P53127 MAK31YCR020C-A 267 nt9.55□□□□□ -0.88
SNT2P53127 SNF4YGL115W 969 nt9.55□□□□□ -0.88
SNT2P53127 RPS5YJR123W 678 nt9.55□□□□□ -0.88
SNT2P53127 OPI11YPR044C 354 nt9.55□□□□□ -0.88
SNT2P53127 ENB1YOL158C 1821 nt9.55□□□□□ -0.88
SNT2P53127 YKR018CYKR018C 2178 nt9.54□□□□□ -0.88
SNT2P53127 HST3YOR025W 1344 nt9.54□□□□□ -0.88
SNT2P53127 CRF1YDR223W 1404 nt9.53□□□□□ -0.88
SNT2P53127 YET3YDL072C 612 nt9.52□□□□□ -0.89
SNT2P53127 LOT6YLR011W 576 nt9.52□□□□□ -0.89
SNT2P53127 PRS2YER099C 957 nt9.51□□□□□ -0.89
SNT2P53127 MDE1YJR024C 735 nt9.51□□□□□ -0.89
SNT2P53127 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt9.51□□□□□ -0.89
SNT2P53127 RDN5-2RDN5-2 119 nt9.5□□□□□ -0.89
SNT2P53127 RDN5-3RDN5-3 119 nt9.5□□□□□ -0.89
SNT2P53127 RDN5-4RDN5-4 119 nt9.5□□□□□ -0.89
SNT2P53127 RDN5-5RDN5-5 119 nt9.5□□□□□ -0.89
SNT2P53127 CAF40YNL288W 1122 nt9.5□□□□□ -0.89
SNT2P53127 CDC19YAL038W 1503 nt9.5□□□□□ -0.89
SNT2P53127 YRF1-2YER190W 5046 nt9.49□□□□□ -0.89
SNT2P53127 JNM1YMR294W 1122 nt9.48□□□□□ -0.89
SNT2P53127 RGD2YFL047W 2145 nt9.48□□□□□ -0.89
SNT2P53127 AMD2YDR242W 1650 nt9.47□□□□□ -0.89
SNT2P53127 HRQ1YDR291W 3234 nt9.47□□□□□ -0.89
SNT2P53127 ERS1YCR075C 783 nt9.47□□□□□ -0.89
SNT2P53127 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt9.46□□□□□ -0.9
SNT2P53127 ILV1YER086W 1731 nt9.46□□□□□ -0.9
SNT2P53127 SFP1YLR403W 2052 nt9.45□□□□□ -0.9
SNT2P53127 RHB1YCR027C 630 nt9.45□□□□□ -0.9
SNT2P53127 MTR3YGR158C 753 nt9.45□□□□□ -0.9
SNT2P53127 RPS3YNL178W 723 nt9.45□□□□□ -0.9
SNT2P53127 RFS1YBR052C 633 nt9.45□□□□□ -0.9
SNT2P53127 ICL1YER065C 1674 nt9.44□□□□□ -0.9
SNT2P53127 YNL120CYNL120C 486 nt9.44□□□□□ -0.9
SNT2P53127 LDB16YCL005W 771 nt9.44□□□□□ -0.9
SNT2P53127 YCR041WYCR041W 333 nt9.43□□□□□ -0.9
SNT2P53127 RPP1YHR062C 882 nt9.43□□□□□ -0.9
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