Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC45.15■■■■■ 4.82
SMARCA4P51532 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC45.14■■■■■ 4.82
SMARCA4P51532 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC45.14■■■■■ 4.82
SMARCA4P51532 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
SMARCA4P51532 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
SMARCA4P51532 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.13■■■■■ 4.82
SMARCA4P51532 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
SMARCA4P51532 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC45.12■■■■■ 4.81
SMARCA4P51532 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
SMARCA4P51532 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC45.11■■■■■ 4.81
SMARCA4P51532 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
SMARCA4P51532 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
SMARCA4P51532 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC45.1■■■■■ 4.81
SMARCA4P51532 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
SMARCA4P51532 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
SMARCA4P51532 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC45.1■■■■■ 4.81
SMARCA4P51532 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC45.09■■■■■ 4.81
SMARCA4P51532 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
SMARCA4P51532 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
SMARCA4P51532 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
SMARCA4P51532 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC45.06■■■■■ 4.8
SMARCA4P51532 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
SMARCA4P51532 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
SMARCA4P51532 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
SMARCA4P51532 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC45.05■■■■■ 4.8
SMARCA4P51532 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC45.04■■■■■ 4.8
SMARCA4P51532 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
SMARCA4P51532 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
SMARCA4P51532 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
SMARCA4P51532 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
SMARCA4P51532 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC45.03■■■■■ 4.8
SMARCA4P51532 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.02■■■■■ 4.8
SMARCA4P51532 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC45.02■■■■■ 4.8
SMARCA4P51532 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC45.02■■■■■ 4.8
SMARCA4P51532 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
SMARCA4P51532 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC44.99■■■■■ 4.79
SMARCA4P51532 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
SMARCA4P51532 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC44.99■■■■■ 4.79
SMARCA4P51532 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
SMARCA4P51532 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
SMARCA4P51532 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC44.97■■■■■ 4.79
SMARCA4P51532 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC44.97■■■■■ 4.79
SMARCA4P51532 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.96■■■■■ 4.79
SMARCA4P51532 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
SMARCA4P51532 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
SMARCA4P51532 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC44.95■■■■■ 4.79
SMARCA4P51532 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
SMARCA4P51532 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC44.94■■■■■ 4.78
SMARCA4P51532 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC44.93■■■■■ 4.78
SMARCA4P51532 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC44.93■■■■■ 4.78
SMARCA4P51532 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC44.93■■■■■ 4.78
SMARCA4P51532 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC44.92■■■■■ 4.78
SMARCA4P51532 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC44.92■■■■■ 4.78
SMARCA4P51532 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
SMARCA4P51532 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
SMARCA4P51532 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
SMARCA4P51532 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC44.91■■■■■ 4.78
SMARCA4P51532 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.9■■■■■ 4.78
SMARCA4P51532 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC44.9■■■■■ 4.78
SMARCA4P51532 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC44.9■■■■■ 4.78
SMARCA4P51532 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC44.89■■■■■ 4.78
SMARCA4P51532 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
SMARCA4P51532 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
SMARCA4P51532 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
SMARCA4P51532 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.88■■■■■ 4.78
SMARCA4P51532 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.77
SMARCA4P51532 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
SMARCA4P51532 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
SMARCA4P51532 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC44.86■■■■■ 4.77
SMARCA4P51532 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
SMARCA4P51532 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
SMARCA4P51532 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
SMARCA4P51532 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
SMARCA4P51532 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
SMARCA4P51532 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.83■■■■■ 4.77
SMARCA4P51532 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
SMARCA4P51532 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC44.82■■■■■ 4.77
SMARCA4P51532 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.82■■■■■ 4.77
SMARCA4P51532 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
SMARCA4P51532 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
SMARCA4P51532 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC44.81■■■■■ 4.76
SMARCA4P51532 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC44.8■■■■■ 4.76
SMARCA4P51532 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC44.8■■■■■ 4.76
SMARCA4P51532 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC44.79■■■■■ 4.76
SMARCA4P51532 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
SMARCA4P51532 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
SMARCA4P51532 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC44.79■■■■■ 4.76
SMARCA4P51532 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.79■■■■■ 4.76
SMARCA4P51532 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC44.78■■■■■ 4.76
SMARCA4P51532 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.78■■■■■ 4.76
SMARCA4P51532 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC44.77■■■■■ 4.76
SMARCA4P51532 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
SMARCA4P51532 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC44.75■■■■■ 4.75
SMARCA4P51532 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
SMARCA4P51532 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
SMARCA4P51532 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.75■■■■■ 4.75
SMARCA4P51532 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC44.75■■■■■ 4.75
SMARCA4P51532 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
SMARCA4P51532 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC44.74■■■■■ 4.75
SMARCA4P51532 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms