Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
SMARCA2P51531 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
SMARCA2P51531 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC44.78■■■■■ 4.76
SMARCA2P51531 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC44.78■■■■■ 4.76
SMARCA2P51531 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
SMARCA2P51531 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
SMARCA2P51531 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.75■■■■■ 4.76
SMARCA2P51531 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.76
SMARCA2P51531 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC44.75■■■■■ 4.75
SMARCA2P51531 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
SMARCA2P51531 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC44.75■■■■■ 4.75
SMARCA2P51531 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
SMARCA2P51531 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC44.75■■■■■ 4.75
SMARCA2P51531 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
SMARCA2P51531 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
SMARCA2P51531 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.73■■■■■ 4.75
SMARCA2P51531 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC44.72■■■■■ 4.75
SMARCA2P51531 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC44.72■■■■■ 4.75
SMARCA2P51531 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC44.72■■■■■ 4.75
SMARCA2P51531 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
SMARCA2P51531 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC44.71■■■■■ 4.75
SMARCA2P51531 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC44.7■■■■■ 4.75
SMARCA2P51531 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.7■■■■■ 4.75
SMARCA2P51531 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
SMARCA2P51531 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC44.69■■■■■ 4.75
SMARCA2P51531 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.75
SMARCA2P51531 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
SMARCA2P51531 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
SMARCA2P51531 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
SMARCA2P51531 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.69■■■■■ 4.74
SMARCA2P51531 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC44.68■■■■■ 4.74
SMARCA2P51531 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
SMARCA2P51531 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC44.67■■■■■ 4.74
SMARCA2P51531 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC44.67■■■■■ 4.74
SMARCA2P51531 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
SMARCA2P51531 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
SMARCA2P51531 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
SMARCA2P51531 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
SMARCA2P51531 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.65■■■■■ 4.74
SMARCA2P51531 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC44.65■■■■■ 4.74
SMARCA2P51531 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
SMARCA2P51531 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC44.64■■■■■ 4.74
SMARCA2P51531 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC44.64■■■■■ 4.74
SMARCA2P51531 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC44.63■■■■■ 4.73
SMARCA2P51531 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC44.62■■■■■ 4.73
SMARCA2P51531 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
SMARCA2P51531 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
SMARCA2P51531 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
SMARCA2P51531 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
SMARCA2P51531 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.6■■■■■ 4.73
SMARCA2P51531 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC44.6■■■■■ 4.73
SMARCA2P51531 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.59■■■■■ 4.73
SMARCA2P51531 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC44.58■■■■■ 4.73
SMARCA2P51531 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
SMARCA2P51531 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
SMARCA2P51531 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
SMARCA2P51531 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC44.56■■■■■ 4.72
SMARCA2P51531 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC44.56■■■■■ 4.72
SMARCA2P51531 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
SMARCA2P51531 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC44.56■■■■■ 4.72
SMARCA2P51531 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
SMARCA2P51531 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC44.55■■■■■ 4.72
SMARCA2P51531 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.55■■■■■ 4.72
SMARCA2P51531 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC44.55■■■■■ 4.72
SMARCA2P51531 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC44.55■■■■■ 4.72
SMARCA2P51531 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
SMARCA2P51531 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
SMARCA2P51531 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC44.54■■■■■ 4.72
SMARCA2P51531 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
SMARCA2P51531 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
SMARCA2P51531 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
SMARCA2P51531 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
SMARCA2P51531 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
SMARCA2P51531 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC44.52■■■■■ 4.72
SMARCA2P51531 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC44.52■■■■■ 4.72
SMARCA2P51531 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC44.51■■■■■ 4.72
SMARCA2P51531 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC44.51■■■■■ 4.72
SMARCA2P51531 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC44.5■■■■■ 4.71
SMARCA2P51531 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
SMARCA2P51531 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC44.48■■■■■ 4.71
SMARCA2P51531 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
SMARCA2P51531 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.48■■■■■ 4.71
SMARCA2P51531 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
SMARCA2P51531 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
SMARCA2P51531 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
SMARCA2P51531 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
SMARCA2P51531 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC44.46■■■■■ 4.71
SMARCA2P51531 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC44.45■■■■■ 4.71
SMARCA2P51531 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
SMARCA2P51531 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC44.45■■■■■ 4.71
SMARCA2P51531 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC44.44■■■■■ 4.71
SMARCA2P51531 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC44.44■■■■■ 4.71
SMARCA2P51531 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.71
SMARCA2P51531 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
SMARCA2P51531 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC44.42■■■■■ 4.7
SMARCA2P51531 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
SMARCA2P51531 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
SMARCA2P51531 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
SMARCA2P51531 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
SMARCA2P51531 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC44.39■■■■■ 4.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms