Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLCSP50747 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLCSP50747 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLCSP50747 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLCSP50747 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLCSP50747 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLCSP50747 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
HLCSP50747 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HLCSP50747 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HLCSP50747 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLCSP50747 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLCSP50747 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLCSP50747 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HLCSP50747 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLCSP50747 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLCSP50747 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLCSP50747 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLCSP50747 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLCSP50747 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLCSP50747 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLCSP50747 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLCSP50747 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HLCSP50747 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLCSP50747 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLCSP50747 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLCSP50747 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLCSP50747 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLCSP50747 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLCSP50747 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLCSP50747 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLCSP50747 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLCSP50747 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLCSP50747 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLCSP50747 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HLCSP50747 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLCSP50747 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLCSP50747 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLCSP50747 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLCSP50747 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLCSP50747 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLCSP50747 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLCSP50747 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLCSP50747 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLCSP50747 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLCSP50747 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLCSP50747 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLCSP50747 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLCSP50747 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLCSP50747 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HLCSP50747 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLCSP50747 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLCSP50747 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLCSP50747 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HLCSP50747 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLCSP50747 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HLCSP50747 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLCSP50747 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLCSP50747 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLCSP50747 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLCSP50747 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLCSP50747 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLCSP50747 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLCSP50747 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLCSP50747 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLCSP50747 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLCSP50747 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLCSP50747 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLCSP50747 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLCSP50747 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLCSP50747 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLCSP50747 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLCSP50747 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLCSP50747 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLCSP50747 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLCSP50747 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLCSP50747 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLCSP50747 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLCSP50747 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLCSP50747 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HLCSP50747 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLCSP50747 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLCSP50747 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLCSP50747 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLCSP50747 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLCSP50747 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLCSP50747 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLCSP50747 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLCSP50747 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLCSP50747 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HLCSP50747 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLCSP50747 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLCSP50747 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLCSP50747 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLCSP50747 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLCSP50747 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLCSP50747 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLCSP50747 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLCSP50747 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLCSP50747 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLCSP50747 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms