Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IDH3AP50213 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IDH3AP50213 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IDH3AP50213 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IDH3AP50213 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IDH3AP50213 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IDH3AP50213 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IDH3AP50213 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IDH3AP50213 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
IDH3AP50213 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IDH3AP50213 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IDH3AP50213 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IDH3AP50213 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IDH3AP50213 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IDH3AP50213 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IDH3AP50213 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IDH3AP50213 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IDH3AP50213 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IDH3AP50213 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IDH3AP50213 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IDH3AP50213 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IDH3AP50213 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IDH3AP50213 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IDH3AP50213 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IDH3AP50213 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IDH3AP50213 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IDH3AP50213 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IDH3AP50213 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IDH3AP50213 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IDH3AP50213 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IDH3AP50213 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IDH3AP50213 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IDH3AP50213 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms