Protein–RNA interactions for Protein: P49914

MTHFS, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFSP49914 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
MTHFSP49914 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
MTHFSP49914 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
MTHFSP49914 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
MTHFSP49914 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
MTHFSP49914 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
MTHFSP49914 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
MTHFSP49914 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
MTHFSP49914 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
MTHFSP49914 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
MTHFSP49914 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
MTHFSP49914 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
MTHFSP49914 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
MTHFSP49914 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MTHFSP49914 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MTHFSP49914 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MTHFSP49914 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MTHFSP49914 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MTHFSP49914 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MTHFSP49914 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
MTHFSP49914 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MTHFSP49914 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
MTHFSP49914 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
MTHFSP49914 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
MTHFSP49914 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
MTHFSP49914 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
MTHFSP49914 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
MTHFSP49914 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
MTHFSP49914 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
MTHFSP49914 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
MTHFSP49914 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
MTHFSP49914 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
MTHFSP49914 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MTHFSP49914 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
MTHFSP49914 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MTHFSP49914 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
MTHFSP49914 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
MTHFSP49914 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
MTHFSP49914 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
MTHFSP49914 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
MTHFSP49914 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
MTHFSP49914 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MTHFSP49914 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
MTHFSP49914 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MTHFSP49914 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
MTHFSP49914 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
MTHFSP49914 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
MTHFSP49914 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
MTHFSP49914 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
MTHFSP49914 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
MTHFSP49914 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
MTHFSP49914 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
MTHFSP49914 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
MTHFSP49914 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
MTHFSP49914 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
MTHFSP49914 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
MTHFSP49914 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
MTHFSP49914 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
MTHFSP49914 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
MTHFSP49914 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
MTHFSP49914 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
MTHFSP49914 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
MTHFSP49914 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
MTHFSP49914 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
MTHFSP49914 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
MTHFSP49914 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33■■■□□ 2.87
MTHFSP49914 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
MTHFSP49914 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
MTHFSP49914 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
MTHFSP49914 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
MTHFSP49914 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
MTHFSP49914 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
MTHFSP49914 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
MTHFSP49914 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
MTHFSP49914 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
MTHFSP49914 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
MTHFSP49914 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
MTHFSP49914 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
MTHFSP49914 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
MTHFSP49914 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
MTHFSP49914 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
MTHFSP49914 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
MTHFSP49914 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
MTHFSP49914 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
MTHFSP49914 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
MTHFSP49914 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
MTHFSP49914 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
MTHFSP49914 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
MTHFSP49914 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
MTHFSP49914 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
MTHFSP49914 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
MTHFSP49914 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
MTHFSP49914 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
MTHFSP49914 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
MTHFSP49914 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
MTHFSP49914 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
MTHFSP49914 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
MTHFSP49914 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
MTHFSP49914 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
MTHFSP49914 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms