Protein–RNA interactions for Protein: P49590

HARS2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARS2P49590 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HARS2P49590 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HARS2P49590 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HARS2P49590 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HARS2P49590 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HARS2P49590 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HARS2P49590 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HARS2P49590 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HARS2P49590 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HARS2P49590 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HARS2P49590 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HARS2P49590 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HARS2P49590 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HARS2P49590 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HARS2P49590 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HARS2P49590 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HARS2P49590 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HARS2P49590 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HARS2P49590 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HARS2P49590 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HARS2P49590 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HARS2P49590 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HARS2P49590 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HARS2P49590 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HARS2P49590 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HARS2P49590 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HARS2P49590 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HARS2P49590 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HARS2P49590 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HARS2P49590 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HARS2P49590 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HARS2P49590 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HARS2P49590 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HARS2P49590 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HARS2P49590 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HARS2P49590 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HARS2P49590 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HARS2P49590 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HARS2P49590 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HARS2P49590 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HARS2P49590 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HARS2P49590 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HARS2P49590 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HARS2P49590 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HARS2P49590 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HARS2P49590 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HARS2P49590 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HARS2P49590 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HARS2P49590 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HARS2P49590 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HARS2P49590 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HARS2P49590 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HARS2P49590 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HARS2P49590 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HARS2P49590 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HARS2P49590 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HARS2P49590 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HARS2P49590 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HARS2P49590 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HARS2P49590 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HARS2P49590 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HARS2P49590 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HARS2P49590 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HARS2P49590 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HARS2P49590 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HARS2P49590 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HARS2P49590 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HARS2P49590 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HARS2P49590 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HARS2P49590 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HARS2P49590 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HARS2P49590 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HARS2P49590 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HARS2P49590 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HARS2P49590 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HARS2P49590 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HARS2P49590 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HARS2P49590 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HARS2P49590 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HARS2P49590 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HARS2P49590 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HARS2P49590 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HARS2P49590 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HARS2P49590 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HARS2P49590 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HARS2P49590 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HARS2P49590 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HARS2P49590 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HARS2P49590 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HARS2P49590 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HARS2P49590 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HARS2P49590 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HARS2P49590 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HARS2P49590 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HARS2P49590 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HARS2P49590 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HARS2P49590 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HARS2P49590 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HARS2P49590 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HARS2P49590 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms