Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 PSMD5-AS1-210ENST00000639576 906 ntTSL 58.57□□□□□ -1.043e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ST3GAL3-213ENST00000372365 673 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.043e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.053e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SZRD1-208ENST00000476423 567 ntTSL 48.43□□□□□ -1.063e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 LINC01811-202ENST00000424786 787 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.063e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ZDHHC17-212ENST00000550876 564 ntTSL 48.38□□□□□ -1.073e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CPSF4-202ENST00000412686 745 ntTSL 58.33□□□□□ -1.083e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ANO10-212ENST00000448045 583 ntTSL 38.32□□□□□ -1.083e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ABCC4-201ENST00000376887 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.093e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.113e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PHF21A-218ENST00000532883 1051 ntTSL 58.12□□□□□ -1.113e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NEPRO-215ENST00000474311 1671 ntTSL 28.09□□□□□ -1.119e-8■■■■■ 61.8
AARSP49588 NCKAP1L-201ENST00000293373 9016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.123e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SOX6-211ENST00000528429 2656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.123e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 HEPH-201ENST00000336279 4228 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.123e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SNX29-201ENST00000562510 536 ntTSL 37.97□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.143e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ARID1B-217ENST00000636607 406 ntTSL 37.93□□□□□ -1.143e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TBL1XR1-231ENST00000637137 107 ntTSL 57.86□□□□□ -1.153e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.153e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.163e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RAB40B-210ENST00000576148 343 ntTSL 37.79□□□□□ -1.163e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.173e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RSRC1-213ENST00000494002 679 ntTSL 27.74□□□□□ -1.173e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TBL1XR1-211ENST00000437738 565 ntTSL 57.71□□□□□ -1.183e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ARID1B-213ENST00000636205 824 ntTSL 27.69□□□□□ -1.183e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.183e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 IFT46-203ENST00000525060 821 ntTSL 57.67□□□□□ -1.183e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ST3GAL3-221ENST00000461375 806 ntTSL 57.65□□□□□ -1.183e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.183e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TBL1XR1-205ENST00000424913 592 ntTSL 47.64□□□□□ -1.193e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RSRC1-209ENST00000477788 755 ntTSL 37.6□□□□□ -1.193e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.199e-8■■■■■ 61.8
AARSP49588 P4HA2-212ENST00000428841 427 ntTSL 37.55□□□□□ -1.23e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ZDHHC17-214ENST00000552453 856 ntTSL 57.55□□□□□ -1.23e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.223e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.223e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TBL1XR1-220ENST00000630796 656 ntTSL 57.43□□□□□ -1.223e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.233e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ITFG1-211ENST00000568047 2636 ntTSL 57.33□□□□□ -1.243e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.243e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.253e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.253e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.253e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.259e-8■■■■■ 61.8
AARSP49588 DNAH14-201ENST00000327794 8488 ntTSL 1 (best)7.14□□□□□ -1.273e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ADAMTS3-202ENST00000505193 1002 ntTSL 27.12□□□□□ -1.273e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.273e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC7.09□□□□□ -1.273e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 KIAA1328-206ENST00000590617 1835 ntTSL 1 (best)7.06□□□□□ -1.283e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 IFT46-209ENST00000531939 1182 ntTSL 27.06□□□□□ -1.283e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 HDAC8-211ENST00000415409 913 ntTSL 56.97□□□□□ -1.293e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.33e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.33e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.33e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ZDHHC17-204ENST00000547620 567 ntTSL 46.92□□□□□ -1.33e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 P4HA2-208ENST00000416053 582 ntTSL 36.91□□□□□ -1.33e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.333e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TRIM25-206ENST00000572550 519 ntTSL 56.75□□□□□ -1.333e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 KIAA1328-205ENST00000590456 563 ntTSL 56.7□□□□□ -1.343e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 LRRC8B-205ENST00000639264 7736 ntAPPRIS P1 TSL 56.66□□□□□ -1.343e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.353e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NCKAP1L-204ENST00000548221 3559 ntTSL 26.54□□□□□ -1.363e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 MGA-203ENST00000561532 532 ntTSL 46.47□□□□□ -1.373e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PPP2R2A-209ENST00000519439 658 ntTSL 36.47□□□□□ -1.373e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.373e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NF1-215ENST00000493220 5691 ntTSL 26.46□□□□□ -1.389e-8■■■■■ 61.8
AARSP49588 ITFG1-210ENST00000567957 924 ntTSL 26.4□□□□□ -1.383e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TMEM80-203ENST00000488769 669 ntTSL 56.33□□□□□ -1.43e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 UQCRH-205ENST00000496387 674 ntTSL 1 (best)6.3□□□□□ -1.43e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.413e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.413e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.413e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.413e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NF1-205ENST00000456735 7787 ntTSL 56.22□□□□□ -1.419e-8■■■■■ 61.8
AARSP49588 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.413e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.423e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PPP2R2A-222ENST00000524099 569 ntTSL 46.2□□□□□ -1.423e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PHF21A-219ENST00000533757 466 ntTSL 56.11□□□□□ -1.433e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.433e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.433e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.453e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NF1-210ENST00000479614 1114 ntTSL 56□□□□□ -1.459e-8■■■■■ 61.8
AARSP49588 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.453e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PHF21A-216ENST00000532010 546 ntTSL 45.96□□□□□ -1.463e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TBL1XR1-224ENST00000635794 768 ntTSL 55.93□□□□□ -1.463e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.473e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.473e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ZDHHC17-209ENST00000550163 730 ntTSL 35.82□□□□□ -1.483e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.483e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PPP2R2A-219ENST00000523473 654 ntTSL 45.77□□□□□ -1.493e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ATXN2-217ENST00000548492 556 ntTSL 45.69□□□□□ -1.53e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PPP2R2A-213ENST00000521095 579 ntTSL 35.62□□□□□ -1.513e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NF1-216ENST00000495910 8223 ntTSL 25.62□□□□□ -1.519e-8■■■■■ 61.8
AARSP49588 ITFG1-202ENST00000537184 1422 ntTSL 25.61□□□□□ -1.513e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.523e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.533e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.533e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NF1-219ENST00000579081 8788 ntTSL 1 (best)5.46□□□□□ -1.539e-8■■■■■ 61.8
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