Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FNTBP49356 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FNTBP49356 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FNTBP49356 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FNTBP49356 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FNTBP49356 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FNTBP49356 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FNTBP49356 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FNTBP49356 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FNTBP49356 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FNTBP49356 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FNTBP49356 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FNTBP49356 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FNTBP49356 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FNTBP49356 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FNTBP49356 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FNTBP49356 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FNTBP49356 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FNTBP49356 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FNTBP49356 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FNTBP49356 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FNTBP49356 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FNTBP49356 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FNTBP49356 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FNTBP49356 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FNTBP49356 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FNTBP49356 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FNTBP49356 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FNTBP49356 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FNTBP49356 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FNTBP49356 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FNTBP49356 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FNTBP49356 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FNTBP49356 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FNTBP49356 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FNTBP49356 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FNTBP49356 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FNTBP49356 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FNTBP49356 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FNTBP49356 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FNTBP49356 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FNTBP49356 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FNTBP49356 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FNTBP49356 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FNTBP49356 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FNTBP49356 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FNTBP49356 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FNTBP49356 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FNTBP49356 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FNTBP49356 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FNTBP49356 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FNTBP49356 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FNTBP49356 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FNTBP49356 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FNTBP49356 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FNTBP49356 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FNTBP49356 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FNTBP49356 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FNTBP49356 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FNTBP49356 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FNTBP49356 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FNTBP49356 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FNTBP49356 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FNTBP49356 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FNTBP49356 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNTBP49356 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNTBP49356 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNTBP49356 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FNTBP49356 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNTBP49356 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNTBP49356 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNTBP49356 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNTBP49356 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FNTBP49356 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FNTBP49356 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FNTBP49356 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FNTBP49356 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FNTBP49356 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FNTBP49356 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FNTBP49356 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNTBP49356 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNTBP49356 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNTBP49356 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNTBP49356 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNTBP49356 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNTBP49356 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FNTBP49356 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNTBP49356 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNTBP49356 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNTBP49356 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNTBP49356 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FNTBP49356 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNTBP49356 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FNTBP49356 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FNTBP49356 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FNTBP49356 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FNTBP49356 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FNTBP49356 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNTBP49356 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FNTBP49356 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms