Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNNI2P48788 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNNI2P48788 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNNI2P48788 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNNI2P48788 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNNI2P48788 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNNI2P48788 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNNI2P48788 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNNI2P48788 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
TNNI2P48788 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNNI2P48788 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNNI2P48788 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNNI2P48788 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNNI2P48788 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNNI2P48788 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNNI2P48788 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNNI2P48788 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNNI2P48788 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNNI2P48788 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNNI2P48788 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNNI2P48788 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNNI2P48788 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNNI2P48788 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNNI2P48788 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNNI2P48788 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNNI2P48788 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNNI2P48788 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNNI2P48788 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TNNI2P48788 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNNI2P48788 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TNNI2P48788 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNNI2P48788 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TNNI2P48788 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNNI2P48788 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNNI2P48788 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNNI2P48788 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNNI2P48788 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNNI2P48788 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TNNI2P48788 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNNI2P48788 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNNI2P48788 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNNI2P48788 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNNI2P48788 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNNI2P48788 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNNI2P48788 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TNNI2P48788 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNNI2P48788 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNNI2P48788 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TNNI2P48788 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNNI2P48788 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNNI2P48788 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNNI2P48788 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNNI2P48788 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNNI2P48788 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNNI2P48788 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNNI2P48788 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNNI2P48788 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNNI2P48788 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNNI2P48788 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNNI2P48788 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNNI2P48788 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNNI2P48788 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNNI2P48788 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNNI2P48788 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNNI2P48788 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNNI2P48788 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNNI2P48788 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNNI2P48788 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNNI2P48788 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNNI2P48788 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNNI2P48788 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNNI2P48788 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNNI2P48788 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNNI2P48788 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNNI2P48788 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNNI2P48788 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNNI2P48788 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNNI2P48788 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNNI2P48788 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNNI2P48788 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNNI2P48788 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNNI2P48788 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNNI2P48788 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNNI2P48788 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNNI2P48788 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNNI2P48788 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNNI2P48788 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNNI2P48788 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNNI2P48788 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNNI2P48788 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNNI2P48788 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNNI2P48788 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNNI2P48788 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNNI2P48788 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNNI2P48788 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNNI2P48788 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNNI2P48788 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNNI2P48788 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNNI2P48788 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNNI2P48788 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms