Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSNK1A1P48729 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK1A1P48729 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK1A1P48729 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK1A1P48729 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK1A1P48729 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK1A1P48729 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK1A1P48729 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK1A1P48729 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK1A1P48729 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK1A1P48729 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK1A1P48729 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSNK1A1P48729 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSNK1A1P48729 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSNK1A1P48729 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSNK1A1P48729 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSNK1A1P48729 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSNK1A1P48729 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSNK1A1P48729 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSNK1A1P48729 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSNK1A1P48729 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSNK1A1P48729 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSNK1A1P48729 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSNK1A1P48729 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSNK1A1P48729 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSNK1A1P48729 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms