Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCP4P48539 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCP4P48539 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCP4P48539 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCP4P48539 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCP4P48539 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCP4P48539 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCP4P48539 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCP4P48539 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCP4P48539 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCP4P48539 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCP4P48539 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCP4P48539 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCP4P48539 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PCP4P48539 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCP4P48539 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCP4P48539 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCP4P48539 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCP4P48539 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCP4P48539 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCP4P48539 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCP4P48539 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCP4P48539 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCP4P48539 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCP4P48539 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCP4P48539 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCP4P48539 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCP4P48539 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCP4P48539 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCP4P48539 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCP4P48539 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCP4P48539 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCP4P48539 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCP4P48539 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCP4P48539 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCP4P48539 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCP4P48539 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCP4P48539 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PCP4P48539 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCP4P48539 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCP4P48539 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCP4P48539 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCP4P48539 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCP4P48539 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCP4P48539 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCP4P48539 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCP4P48539 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCP4P48539 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCP4P48539 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCP4P48539 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCP4P48539 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCP4P48539 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCP4P48539 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCP4P48539 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCP4P48539 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCP4P48539 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCP4P48539 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PCP4P48539 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PCP4P48539 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCP4P48539 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCP4P48539 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCP4P48539 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCP4P48539 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCP4P48539 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCP4P48539 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCP4P48539 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCP4P48539 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCP4P48539 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCP4P48539 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCP4P48539 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCP4P48539 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCP4P48539 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCP4P48539 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCP4P48539 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCP4P48539 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCP4P48539 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCP4P48539 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCP4P48539 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCP4P48539 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCP4P48539 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCP4P48539 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCP4P48539 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCP4P48539 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCP4P48539 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCP4P48539 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCP4P48539 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCP4P48539 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCP4P48539 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCP4P48539 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCP4P48539 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCP4P48539 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCP4P48539 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCP4P48539 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCP4P48539 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCP4P48539 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCP4P48539 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCP4P48539 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCP4P48539 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCP4P48539 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCP4P48539 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms