Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCLMP48507 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCLMP48507 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCLMP48507 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCLMP48507 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCLMP48507 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCLMP48507 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCLMP48507 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCLMP48507 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCLMP48507 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCLMP48507 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCLMP48507 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCLMP48507 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GCLMP48507 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GCLMP48507 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCLMP48507 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCLMP48507 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCLMP48507 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCLMP48507 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GCLMP48507 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GCLMP48507 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GCLMP48507 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GCLMP48507 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GCLMP48507 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GCLMP48507 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GCLMP48507 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GCLMP48507 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GCLMP48507 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GCLMP48507 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GCLMP48507 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GCLMP48507 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCLMP48507 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCLMP48507 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCLMP48507 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCLMP48507 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GCLMP48507 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GCLMP48507 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCLMP48507 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCLMP48507 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCLMP48507 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCLMP48507 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCLMP48507 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GCLMP48507 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GCLMP48507 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GCLMP48507 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GCLMP48507 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GCLMP48507 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GCLMP48507 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GCLMP48507 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GCLMP48507 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GCLMP48507 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GCLMP48507 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GCLMP48507 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GCLMP48507 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GCLMP48507 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GCLMP48507 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GCLMP48507 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCLMP48507 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCLMP48507 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCLMP48507 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCLMP48507 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCLMP48507 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCLMP48507 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCLMP48507 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GCLMP48507 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GCLMP48507 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GCLMP48507 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GCLMP48507 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GCLMP48507 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GCLMP48507 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCLMP48507 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCLMP48507 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCLMP48507 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCLMP48507 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCLMP48507 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCLMP48507 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCLMP48507 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCLMP48507 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCLMP48507 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCLMP48507 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCLMP48507 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GCLMP48507 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GCLMP48507 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCLMP48507 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCLMP48507 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCLMP48507 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GCLMP48507 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCLMP48507 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCLMP48507 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCLMP48507 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GCLMP48507 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GCLMP48507 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCLMP48507 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCLMP48507 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCLMP48507 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCLMP48507 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCLMP48507 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCLMP48507 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCLMP48507 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCLMP48507 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms