Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A9P48067 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A9P48067 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A9P48067 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A9P48067 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A9P48067 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A9P48067 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A9P48067 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A9P48067 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A9P48067 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A9P48067 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A9P48067 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A9P48067 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A9P48067 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC6A9P48067 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A9P48067 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A9P48067 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A9P48067 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A9P48067 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A9P48067 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A9P48067 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A9P48067 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A9P48067 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A9P48067 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A9P48067 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A9P48067 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A9P48067 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A9P48067 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A9P48067 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A9P48067 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A9P48067 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A9P48067 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A9P48067 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A9P48067 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A9P48067 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A9P48067 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A9P48067 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A9P48067 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A9P48067 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A9P48067 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A9P48067 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A9P48067 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A9P48067 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A9P48067 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A9P48067 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A9P48067 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A9P48067 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC6A9P48067 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms