Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPHP41219 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPHP41219 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPHP41219 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPHP41219 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPHP41219 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPHP41219 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPHP41219 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPHP41219 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPHP41219 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPHP41219 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPHP41219 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPHP41219 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPHP41219 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPHP41219 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPHP41219 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPHP41219 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPHP41219 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPHP41219 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPHP41219 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPHP41219 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPHP41219 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPHP41219 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPHP41219 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPHP41219 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PRPHP41219 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PRPHP41219 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PRPHP41219 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPHP41219 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPHP41219 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPHP41219 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPHP41219 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPHP41219 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPHP41219 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPHP41219 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPHP41219 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPHP41219 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPHP41219 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPHP41219 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPHP41219 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPHP41219 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPHP41219 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPHP41219 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPHP41219 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPHP41219 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPHP41219 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPHP41219 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPHP41219 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPHP41219 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPHP41219 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPHP41219 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPHP41219 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPHP41219 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPHP41219 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPHP41219 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPHP41219 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPHP41219 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPHP41219 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPHP41219 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPHP41219 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPHP41219 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPHP41219 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPHP41219 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRPHP41219 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRPHP41219 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPHP41219 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPHP41219 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPHP41219 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPHP41219 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPHP41219 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPHP41219 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPHP41219 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPHP41219 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPHP41219 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPHP41219 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPHP41219 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPHP41219 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPHP41219 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPHP41219 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPHP41219 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPHP41219 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPHP41219 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRPHP41219 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PRPHP41219 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRPHP41219 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRPHP41219 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRPHP41219 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRPHP41219 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPHP41219 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPHP41219 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPHP41219 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPHP41219 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPHP41219 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPHP41219 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPHP41219 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRPHP41219 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRPHP41219 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPHP41219 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPHP41219 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPHP41219 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1429.7 ms