Protein–RNA interactions for Protein: P40003

VAB2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit VAB2, yeastyeast

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAB2P40003 HXT9YJL219W 1704 nt7.28□□□□□ -1.24
VAB2P40003 SIT4YDL047W 936 nt7.28□□□□□ -1.24
VAB2P40003 RAD59YDL059C 717 nt7.28□□□□□ -1.24
VAB2P40003 EGD2YHR193C 525 nt7.28□□□□□ -1.24
VAB2P40003 RUF23RUF23 254 nt7.28□□□□□ -1.24
VAB2P40003 MSO1YNR049C 633 nt7.28□□□□□ -1.24
VAB2P40003 TDP1YBR223C 1635 nt7.27□□□□□ -1.25
VAB2P40003 FRT1YOR324C 1809 nt7.27□□□□□ -1.25
VAB2P40003 GUT1YHL032C 2130 nt7.27□□□□□ -1.25
VAB2P40003 YDL177CYDL177C 513 nt7.27□□□□□ -1.25
VAB2P40003 CBR1YIL043C 855 nt7.27□□□□□ -1.25
VAB2P40003 LYS1YIR034C 1122 nt7.27□□□□□ -1.25
VAB2P40003 ATG36YJL185C 882 nt7.27□□□□□ -1.25
VAB2P40003 SRL2YLR082C 1179 nt7.27□□□□□ -1.25
VAB2P40003 PTC3YBL056W 1407 nt7.27□□□□□ -1.25
VAB2P40003 EXG2YDR261C 1689 nt7.26□□□□□ -1.25
VAB2P40003 GPA2YER020W 1350 nt7.26□□□□□ -1.25
VAB2P40003 YSC83YHR017W 1158 nt7.26□□□□□ -1.25
VAB2P40003 ENV7YPL236C 1095 nt7.26□□□□□ -1.25
VAB2P40003 YPL264CYPL264C 1062 nt7.26□□□□□ -1.25
VAB2P40003 PUS7YOR243C 2031 nt7.26□□□□□ -1.25
VAB2P40003 YLL066CYLL066C 3618 nt7.26□□□□□ -1.25
VAB2P40003 YLL067CYLL067C 3618 nt7.26□□□□□ -1.25
VAB2P40003 LAS17YOR181W 1902 nt7.26□□□□□ -1.25
VAB2P40003 PMA2YPL036W 2844 nt7.25□□□□□ -1.25
VAB2P40003 FAL1YDR021W 1200 nt7.25□□□□□ -1.25
VAB2P40003 URH1YDR400W 1023 nt7.25□□□□□ -1.25
VAB2P40003 SYF2YGR129W 648 nt7.25□□□□□ -1.25
VAB2P40003 PSR2YLR019W 1194 nt7.25□□□□□ -1.25
VAB2P40003 AAT2YLR027C 1257 nt7.25□□□□□ -1.25
VAB2P40003 RFC4YOL094C 972 nt7.25□□□□□ -1.25
VAB2P40003 CAN1YEL063C 1773 nt7.25□□□□□ -1.25
VAB2P40003 RVB2YPL235W 1416 nt7.24□□□□□ -1.25
VAB2P40003 FCY2YER056C 1602 nt7.23□□□□□ -1.25
VAB2P40003 FLC2YAL053W 2352 nt7.23□□□□□ -1.25
VAB2P40003 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt7.22□□□□□ -1.25
VAB2P40003 CSL4YNL232W 879 nt7.22□□□□□ -1.25
VAB2P40003 YJL045WYJL045W 1905 nt7.22□□□□□ -1.25
VAB2P40003 SUR7YML052W 909 nt7.21□□□□□ -1.26
VAB2P40003 TUF1YOR187W 1314 nt7.21□□□□□ -1.26
VAB2P40003 YJR084WYJR084W 1272 nt7.2□□□□□ -1.26
VAB2P40003 PRY3YJL078C 2646 nt7.19□□□□□ -1.26
VAB2P40003 YDL218WYDL218W 954 nt7.19□□□□□ -1.26
VAB2P40003 YJR154WYJR154W 1041 nt7.19□□□□□ -1.26
VAB2P40003 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt7.19□□□□□ -1.26
VAB2P40003 YPL257WYPL257W 582 nt7.19□□□□□ -1.26
VAB2P40003 CRF1YDR223W 1404 nt7.18□□□□□ -1.26
VAB2P40003 PRC1YMR297W 1599 nt7.18□□□□□ -1.26
VAB2P40003 snR82snR82 268 nt7.18□□□□□ -1.26
VAB2P40003 TRS31YDR472W 852 nt7.18□□□□□ -1.26
VAB2P40003 MTF2YDL044C 1323 nt7.18□□□□□ -1.26
VAB2P40003 ARE2YNR019W 1929 nt7.17□□□□□ -1.26
VAB2P40003 NTE1YML059C 5040 nt7.17□□□□□ -1.26
VAB2P40003 BUD32YGR262C 786 nt7.17□□□□□ -1.26
VAB2P40003 YJR146WYJR146W 354 nt7.17□□□□□ -1.26
VAB2P40003 SHP1YBL058W 1272 nt7.17□□□□□ -1.26
VAB2P40003 YNL200CYNL200C 741 nt7.17□□□□□ -1.26
VAB2P40003 CTF3YLR381W 2202 nt7.17□□□□□ -1.26
VAB2P40003 GGC1YDL198C 903 nt7.16□□□□□ -1.26
VAB2P40003 SDH4YDR178W 546 nt7.16□□□□□ -1.26
VAB2P40003 DON1YDR273W 1098 nt7.16□□□□□ -1.26
VAB2P40003 PTC4YBR125C 1182 nt7.16□□□□□ -1.26
VAB2P40003 DOT5YIL010W 648 nt7.15□□□□□ -1.26
VAB2P40003 AIM34YMR003W 597 nt7.15□□□□□ -1.26
VAB2P40003 GTO3YMR251W 1101 nt7.15□□□□□ -1.26
VAB2P40003 GLC8YMR311C 690 nt7.15□□□□□ -1.26
VAB2P40003 YDR015CYDR015C 240 nt7.14□□□□□ -1.27
VAB2P40003 ITR1YDR497C 1755 nt7.14□□□□□ -1.27
VAB2P40003 ECM19YLR390W 339 nt7.14□□□□□ -1.27
VAB2P40003 YPL102CYPL102C 303 nt7.14□□□□□ -1.27
VAB2P40003 OPI11YPR044C 354 nt7.14□□□□□ -1.27
VAB2P40003 PAC2YER007W 1557 nt7.13□□□□□ -1.27
VAB2P40003 SKS1YPL026C 1509 nt7.13□□□□□ -1.27
VAB2P40003 LOT6YLR011W 576 nt7.13□□□□□ -1.27
VAB2P40003 OGG1YML060W 1131 nt7.12□□□□□ -1.27
VAB2P40003 KSH1YNL024C-A 219 nt7.12□□□□□ -1.27
VAB2P40003 RSC30YHR056C 2652 nt7.12□□□□□ -1.27
VAB2P40003 PPT1YGR123C 1542 nt7.11□□□□□ -1.27
VAB2P40003 MTC2YKL098W 1074 nt7.11□□□□□ -1.27
VAB2P40003 SPE4YLR146C 903 nt7.11□□□□□ -1.27
VAB2P40003 YNL285WYNL285W 372 nt7.11□□□□□ -1.27
VAB2P40003 AMN1YBR158W 1650 nt7.11□□□□□ -1.27
VAB2P40003 YGR054WYGR054W 1929 nt7.11□□□□□ -1.27
VAB2P40003 YCR041WYCR041W 333 nt7.1□□□□□ -1.27
VAB2P40003 GCV3YAL044C 513 nt7.1□□□□□ -1.27
VAB2P40003 SNT309YPR101W 528 nt7.1□□□□□ -1.27
VAB2P40003 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt7.1□□□□□ -1.27
VAB2P40003 YKR018CYKR018C 2178 nt7.1□□□□□ -1.27
VAB2P40003 STT3YGL022W 2157 nt7.09□□□□□ -1.27
VAB2P40003 YIL108WYIL108W 2091 nt7.09□□□□□ -1.27
VAB2P40003 MRPL28YDR462W 444 nt7.09□□□□□ -1.27
VAB2P40003 MDE1YJR024C 735 nt7.09□□□□□ -1.27
VAB2P40003 DID2YKR035W-A 615 nt7.09□□□□□ -1.27
VAB2P40003 YLR126CYLR126C 756 nt7.09□□□□□ -1.27
VAB2P40003 YNL017CYNL017C 339 nt7.09□□□□□ -1.27
VAB2P40003 ELA1YNL230C 1140 nt7.09□□□□□ -1.27
VAB2P40003 CEM1YER061C 1329 nt7.08□□□□□ -1.28
VAB2P40003 CMK2YOL016C 1344 nt7.08□□□□□ -1.28
VAB2P40003 MAK31YCR020C-A 267 nt7.08□□□□□ -1.28
VAB2P40003 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 54.5 ms