Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GGCXP38435 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GGCXP38435 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GGCXP38435 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GGCXP38435 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GGCXP38435 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GGCXP38435 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GGCXP38435 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GGCXP38435 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GGCXP38435 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GGCXP38435 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
GGCXP38435 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GGCXP38435 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GGCXP38435 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GGCXP38435 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GGCXP38435 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GGCXP38435 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GGCXP38435 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GGCXP38435 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GGCXP38435 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GGCXP38435 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GGCXP38435 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GGCXP38435 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GGCXP38435 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GGCXP38435 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GGCXP38435 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GGCXP38435 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GGCXP38435 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GGCXP38435 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GGCXP38435 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GGCXP38435 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GGCXP38435 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GGCXP38435 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GGCXP38435 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GGCXP38435 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GGCXP38435 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GGCXP38435 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GGCXP38435 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GGCXP38435 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GGCXP38435 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GGCXP38435 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GGCXP38435 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GGCXP38435 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GGCXP38435 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GGCXP38435 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GGCXP38435 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GGCXP38435 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GGCXP38435 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GGCXP38435 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GGCXP38435 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GGCXP38435 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GGCXP38435 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GGCXP38435 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GGCXP38435 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GGCXP38435 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GGCXP38435 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GGCXP38435 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GGCXP38435 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GGCXP38435 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GGCXP38435 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GGCXP38435 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GGCXP38435 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GGCXP38435 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GGCXP38435 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GGCXP38435 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GGCXP38435 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GGCXP38435 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GGCXP38435 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GGCXP38435 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GGCXP38435 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GGCXP38435 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GGCXP38435 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GGCXP38435 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GGCXP38435 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GGCXP38435 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GGCXP38435 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GGCXP38435 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GGCXP38435 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GGCXP38435 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GGCXP38435 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GGCXP38435 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GGCXP38435 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GGCXP38435 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GGCXP38435 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GGCXP38435 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GGCXP38435 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GGCXP38435 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GGCXP38435 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GGCXP38435 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GGCXP38435 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GGCXP38435 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GGCXP38435 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GGCXP38435 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GGCXP38435 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GGCXP38435 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GGCXP38435 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GGCXP38435 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GGCXP38435 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GGCXP38435 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GGCXP38435 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms