Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ZEB1P37275 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ZEB1P37275 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ZEB1P37275 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ZEB1P37275 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
ZEB1P37275 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ZEB1P37275 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ZEB1P37275 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ZEB1P37275 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ZEB1P37275 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ZEB1P37275 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
ZEB1P37275 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
ZEB1P37275 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
ZEB1P37275 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
ZEB1P37275 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ZEB1P37275 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ZEB1P37275 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
ZEB1P37275 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
ZEB1P37275 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ZEB1P37275 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ZEB1P37275 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ZEB1P37275 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ZEB1P37275 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ZEB1P37275 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ZEB1P37275 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ZEB1P37275 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ZEB1P37275 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ZEB1P37275 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ZEB1P37275 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ZEB1P37275 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ZEB1P37275 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ZEB1P37275 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ZEB1P37275 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ZEB1P37275 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ZEB1P37275 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ZEB1P37275 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
ZEB1P37275 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ZEB1P37275 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ZEB1P37275 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ZEB1P37275 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ZEB1P37275 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ZEB1P37275 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ZEB1P37275 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ZEB1P37275 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ZEB1P37275 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ZEB1P37275 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ZEB1P37275 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ZEB1P37275 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ZEB1P37275 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ZEB1P37275 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ZEB1P37275 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ZEB1P37275 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ZEB1P37275 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
ZEB1P37275 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ZEB1P37275 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ZEB1P37275 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ZEB1P37275 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ZEB1P37275 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ZEB1P37275 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ZEB1P37275 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ZEB1P37275 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ZEB1P37275 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ZEB1P37275 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ZEB1P37275 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ZEB1P37275 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ZEB1P37275 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ZEB1P37275 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ZEB1P37275 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ZEB1P37275 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ZEB1P37275 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ZEB1P37275 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ZEB1P37275 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ZEB1P37275 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ZEB1P37275 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ZEB1P37275 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ZEB1P37275 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ZEB1P37275 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ZEB1P37275 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ZEB1P37275 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ZEB1P37275 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ZEB1P37275 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ZEB1P37275 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ZEB1P37275 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ZEB1P37275 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
ZEB1P37275 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ZEB1P37275 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
ZEB1P37275 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
ZEB1P37275 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
ZEB1P37275 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ZEB1P37275 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ZEB1P37275 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ZEB1P37275 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ZEB1P37275 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ZEB1P37275 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ZEB1P37275 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ZEB1P37275 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ZEB1P37275 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
ZEB1P37275 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ZEB1P37275 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ZEB1P37275 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms