Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDIT3P35638 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDIT3P35638 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDIT3P35638 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDIT3P35638 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDIT3P35638 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDIT3P35638 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDIT3P35638 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
DDIT3P35638 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDIT3P35638 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDIT3P35638 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDIT3P35638 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDIT3P35638 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDIT3P35638 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDIT3P35638 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDIT3P35638 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
DDIT3P35638 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDIT3P35638 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDIT3P35638 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDIT3P35638 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDIT3P35638 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDIT3P35638 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDIT3P35638 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDIT3P35638 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
DDIT3P35638 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
DDIT3P35638 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDIT3P35638 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDIT3P35638 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDIT3P35638 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDIT3P35638 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDIT3P35638 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDIT3P35638 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDIT3P35638 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDIT3P35638 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDIT3P35638 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDIT3P35638 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDIT3P35638 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDIT3P35638 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
DDIT3P35638 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDIT3P35638 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDIT3P35638 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDIT3P35638 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDIT3P35638 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDIT3P35638 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDIT3P35638 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDIT3P35638 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDIT3P35638 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDIT3P35638 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDIT3P35638 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDIT3P35638 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDIT3P35638 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
DDIT3P35638 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDIT3P35638 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDIT3P35638 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDIT3P35638 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDIT3P35638 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDIT3P35638 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDIT3P35638 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDIT3P35638 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDIT3P35638 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDIT3P35638 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDIT3P35638 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDIT3P35638 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDIT3P35638 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDIT3P35638 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDIT3P35638 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDIT3P35638 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDIT3P35638 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDIT3P35638 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDIT3P35638 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDIT3P35638 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
DDIT3P35638 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDIT3P35638 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDIT3P35638 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDIT3P35638 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDIT3P35638 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDIT3P35638 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDIT3P35638 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDIT3P35638 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDIT3P35638 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDIT3P35638 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
DDIT3P35638 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDIT3P35638 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDIT3P35638 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDIT3P35638 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDIT3P35638 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
DDIT3P35638 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDIT3P35638 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDIT3P35638 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDIT3P35638 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDIT3P35638 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
DDIT3P35638 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DDIT3P35638 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DDIT3P35638 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DDIT3P35638 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DDIT3P35638 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDIT3P35638 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDIT3P35638 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDIT3P35638 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDIT3P35638 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms