Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC8A1P32418 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC8A1P32418 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC8A1P32418 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC8A1P32418 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC8A1P32418 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC8A1P32418 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC8A1P32418 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC8A1P32418 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC8A1P32418 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC8A1P32418 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC8A1P32418 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC8A1P32418 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC8A1P32418 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC8A1P32418 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC8A1P32418 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC8A1P32418 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC8A1P32418 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC8A1P32418 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC8A1P32418 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC8A1P32418 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC8A1P32418 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC8A1P32418 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC8A1P32418 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC8A1P32418 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC8A1P32418 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC8A1P32418 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC8A1P32418 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC8A1P32418 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC8A1P32418 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC8A1P32418 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC8A1P32418 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC8A1P32418 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC8A1P32418 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC8A1P32418 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC8A1P32418 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC8A1P32418 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC8A1P32418 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC8A1P32418 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC8A1P32418 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC8A1P32418 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC8A1P32418 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC8A1P32418 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC8A1P32418 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC8A1P32418 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC8A1P32418 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC8A1P32418 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC8A1P32418 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC8A1P32418 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8A1P32418 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8A1P32418 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8A1P32418 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8A1P32418 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8A1P32418 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8A1P32418 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8A1P32418 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8A1P32418 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8A1P32418 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8A1P32418 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8A1P32418 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC8A1P32418 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC8A1P32418 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC8A1P32418 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC8A1P32418 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC8A1P32418 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC8A1P32418 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC8A1P32418 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC8A1P32418 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC8A1P32418 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC8A1P32418 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC8A1P32418 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC8A1P32418 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC8A1P32418 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC8A1P32418 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC8A1P32418 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC8A1P32418 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC8A1P32418 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC8A1P32418 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC8A1P32418 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC8A1P32418 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC8A1P32418 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC8A1P32418 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC8A1P32418 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC8A1P32418 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC8A1P32418 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC8A1P32418 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC8A1P32418 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC8A1P32418 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC8A1P32418 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC8A1P32418 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC8A1P32418 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC8A1P32418 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC8A1P32418 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC8A1P32418 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC8A1P32418 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC8A1P32418 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC8A1P32418 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms