Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
L1CAMP32004 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
L1CAMP32004 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
L1CAMP32004 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
L1CAMP32004 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
L1CAMP32004 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
L1CAMP32004 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
L1CAMP32004 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
L1CAMP32004 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
L1CAMP32004 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
L1CAMP32004 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
L1CAMP32004 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
L1CAMP32004 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
L1CAMP32004 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
L1CAMP32004 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
L1CAMP32004 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
L1CAMP32004 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
L1CAMP32004 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
L1CAMP32004 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
L1CAMP32004 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
L1CAMP32004 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
L1CAMP32004 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
L1CAMP32004 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
L1CAMP32004 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
L1CAMP32004 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
L1CAMP32004 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
L1CAMP32004 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
L1CAMP32004 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
L1CAMP32004 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
L1CAMP32004 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
L1CAMP32004 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
L1CAMP32004 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
L1CAMP32004 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
L1CAMP32004 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
L1CAMP32004 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
L1CAMP32004 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
L1CAMP32004 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
L1CAMP32004 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
L1CAMP32004 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
L1CAMP32004 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
L1CAMP32004 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
L1CAMP32004 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
L1CAMP32004 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
L1CAMP32004 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
L1CAMP32004 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
L1CAMP32004 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
L1CAMP32004 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
L1CAMP32004 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
L1CAMP32004 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
L1CAMP32004 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
L1CAMP32004 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
L1CAMP32004 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
L1CAMP32004 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
L1CAMP32004 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
L1CAMP32004 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
L1CAMP32004 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
L1CAMP32004 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
L1CAMP32004 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
L1CAMP32004 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms