Protein–RNA interactions for Protein: P31930

UQCRC1, Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCRC1P31930 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UQCRC1P31930 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UQCRC1P31930 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UQCRC1P31930 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UQCRC1P31930 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UQCRC1P31930 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UQCRC1P31930 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UQCRC1P31930 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UQCRC1P31930 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UQCRC1P31930 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UQCRC1P31930 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UQCRC1P31930 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UQCRC1P31930 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UQCRC1P31930 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UQCRC1P31930 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UQCRC1P31930 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UQCRC1P31930 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UQCRC1P31930 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UQCRC1P31930 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UQCRC1P31930 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UQCRC1P31930 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UQCRC1P31930 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UQCRC1P31930 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UQCRC1P31930 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UQCRC1P31930 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UQCRC1P31930 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UQCRC1P31930 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UQCRC1P31930 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UQCRC1P31930 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
UQCRC1P31930 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UQCRC1P31930 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms