Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMOD1P29536 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMOD1P29536 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
LMOD1P29536 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMOD1P29536 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMOD1P29536 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMOD1P29536 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
LMOD1P29536 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LMOD1P29536 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LMOD1P29536 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMOD1P29536 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMOD1P29536 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMOD1P29536 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMOD1P29536 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMOD1P29536 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMOD1P29536 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMOD1P29536 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMOD1P29536 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMOD1P29536 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMOD1P29536 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMOD1P29536 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMOD1P29536 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMOD1P29536 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMOD1P29536 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMOD1P29536 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMOD1P29536 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMOD1P29536 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMOD1P29536 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMOD1P29536 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMOD1P29536 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMOD1P29536 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMOD1P29536 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMOD1P29536 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMOD1P29536 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMOD1P29536 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMOD1P29536 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMOD1P29536 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMOD1P29536 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMOD1P29536 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
LMOD1P29536 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMOD1P29536 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMOD1P29536 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMOD1P29536 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMOD1P29536 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMOD1P29536 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMOD1P29536 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMOD1P29536 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMOD1P29536 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
LMOD1P29536 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LMOD1P29536 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LMOD1P29536 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LMOD1P29536 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LMOD1P29536 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LMOD1P29536 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LMOD1P29536 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
LMOD1P29536 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
LMOD1P29536 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
LMOD1P29536 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
LMOD1P29536 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LMOD1P29536 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LMOD1P29536 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LMOD1P29536 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LMOD1P29536 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LMOD1P29536 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LMOD1P29536 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LMOD1P29536 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMOD1P29536 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMOD1P29536 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMOD1P29536 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMOD1P29536 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMOD1P29536 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMOD1P29536 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LMOD1P29536 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LMOD1P29536 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LMOD1P29536 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LMOD1P29536 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
LMOD1P29536 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
LMOD1P29536 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMOD1P29536 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMOD1P29536 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMOD1P29536 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMOD1P29536 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMOD1P29536 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMOD1P29536 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMOD1P29536 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMOD1P29536 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMOD1P29536 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMOD1P29536 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMOD1P29536 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMOD1P29536 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMOD1P29536 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMOD1P29536 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMOD1P29536 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMOD1P29536 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
LMOD1P29536 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMOD1P29536 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMOD1P29536 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
LMOD1P29536 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMOD1P29536 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMOD1P29536 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms