Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFRSF8P28908 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFRSF8P28908 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFRSF8P28908 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFRSF8P28908 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFRSF8P28908 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFRSF8P28908 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFRSF8P28908 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFRSF8P28908 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFRSF8P28908 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFRSF8P28908 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFRSF8P28908 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFRSF8P28908 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFRSF8P28908 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFRSF8P28908 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFRSF8P28908 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFRSF8P28908 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFRSF8P28908 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFRSF8P28908 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFRSF8P28908 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFRSF8P28908 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFRSF8P28908 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFRSF8P28908 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFRSF8P28908 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFRSF8P28908 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFRSF8P28908 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFRSF8P28908 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFRSF8P28908 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFRSF8P28908 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFRSF8P28908 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFRSF8P28908 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFRSF8P28908 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFRSF8P28908 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFRSF8P28908 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFRSF8P28908 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFRSF8P28908 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFRSF8P28908 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFRSF8P28908 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFRSF8P28908 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFRSF8P28908 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFRSF8P28908 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFRSF8P28908 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFRSF8P28908 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF8P28908 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF8P28908 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF8P28908 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF8P28908 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF8P28908 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF8P28908 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF8P28908 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF8P28908 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF8P28908 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF8P28908 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF8P28908 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF8P28908 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF8P28908 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF8P28908 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF8P28908 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF8P28908 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF8P28908 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF8P28908 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF8P28908 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF8P28908 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF8P28908 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF8P28908 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF8P28908 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms