Protein–RNA interactions for Protein: P25024

CXCR1, C-X-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR1P25024 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCR1P25024 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCR1P25024 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCR1P25024 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCR1P25024 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCR1P25024 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCR1P25024 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCR1P25024 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCR1P25024 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCR1P25024 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCR1P25024 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCR1P25024 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCR1P25024 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCR1P25024 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCR1P25024 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCR1P25024 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCR1P25024 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCR1P25024 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCR1P25024 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCR1P25024 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCR1P25024 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCR1P25024 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCR1P25024 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCR1P25024 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR1P25024 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR1P25024 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR1P25024 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR1P25024 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR1P25024 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCR1P25024 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCR1P25024 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCR1P25024 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR1P25024 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR1P25024 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR1P25024 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR1P25024 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR1P25024 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR1P25024 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR1P25024 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR1P25024 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR1P25024 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR1P25024 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR1P25024 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR1P25024 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR1P25024 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR1P25024 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR1P25024 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR1P25024 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR1P25024 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR1P25024 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR1P25024 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR1P25024 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR1P25024 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR1P25024 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR1P25024 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR1P25024 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR1P25024 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR1P25024 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR1P25024 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR1P25024 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR1P25024 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CXCR1P25024 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CXCR1P25024 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCR1P25024 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms